RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 KRT15P19012 456 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 ERFEQ4G0M1 354 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 KRT40Q6A162 431 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 GSTA2P09210 222 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 HOXD10P28358 340 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 RTKN2Q8IZC4 609 aa11.61□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 BBOX1O75936 387 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 CPA1P15085 419 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 POLIQ9UNA4 740 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 KRT222Q8N1A0 295 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 CDHR1Q96JP9 859 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
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TRPS1-201ENST00000220888 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 FAM149B1Q96BN6 582 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 SCYL1Q96KG9 808 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 VCXQ9H320 206 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 BAG5Q9UL15 447 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 PHKG2P15735 406 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPS1-201ENST00000220888 HPDP32754 393 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
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