RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641549.1

PTPRVP-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene PTPRVP, Length 5,067 nt, Biotype transcribed unitary pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-205ENST00000641549 PALLDQ8WX93 1383 aa14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MTX1Q13505 466 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PNOCQ13519 176 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 INF2Q27J81 1249 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TPH2Q8IWU9 490 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 BTBD18B2RXH4 712 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PPP6R2O75170 966 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 HDXQ7Z353 690 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 AMNQ9BXJ7 453 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.93□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CYP27B1O15528 508 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RXRBP28702 533 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CUL4AQ13619 759 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CFAP58Q5T655 872 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GPBP1Q86WP2 473 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 BLZF1Q9H2G9 400 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 EVCP57679 992 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ARHGEF16Q5VV41 709 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 IFT81Q8WYA0 676 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 M0R2C6 588 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TTLL1O95922 423 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GRAPQ13588 217 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SLC39A14Q15043 492 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TNS3Q68CZ2 1445 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 LAMC1P11047 1609 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 RPS6KA4O75676 772 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PRR16Q569H4 304 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TRIM37O94972 964 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TAF12Q16514 161 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 AK8Q96MA6 479 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NR1I2O75469 434 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SASH1O94885 1247 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ALAS1P13196 640 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TECP42680 631 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 SIRT2Q8IXJ6 389 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CA8P35219 290 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CCDC114Q96M63 670 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa14.91□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NDC80O14777 642 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CROCCP2Q86T23 111 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TIGD1Q96MW7 591 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TBC1D7Q9P0N9 293 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 V9GYY5 206 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 TMEM232C9JQI7 657 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 LIFRP42702 1097 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 PRKG1Q13976 671 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 C8orf74Q6P047 294 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 HACE1Q8IYU2 909 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 STAMQ92783 540 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 MADDQ8WXG6 1647 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.9□□□□□ -0.02
PTPRVP-205ENST00000641549 ATP5DP30049 168 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.6 ms