RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637624.1

PXN-222, Transcript of paxillin, human

TSL 2

Gene PXN, Length 4,132 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PXN-222	ENST00000637624	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ6	P48051	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	TRIM14	Q14142	442 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	KRT71	Q3SY84	523 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PAK1	Q13153	545 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	WTAP	Q15007	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	NSRP1	Q9H0G5	558 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	BTBD18	B2RXH4	712 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	GUCY2D	Q02846	1103 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	NBPF14	Q5TI25	921 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	COG1	Q8WTW3	980 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	CD248	Q9HCU0	757 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	TEX33	O43247	280 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	STARD3NL	O95772	234 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	MAGEA1	P43355	309 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	TNNC1	P63316	161 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	EIF4E1B	A6NMX2	242 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	FBF1	Q8TES7	1133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	IFIH1	Q9BYX4	1025 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	IRAK1	P51617	712 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	L1RE1	Q9UN81	338 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PLCD1	P51178	756 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PTPRO	Q16827	1216 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PIGB	Q92521	554 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	ANKRD62	A6NC57	917 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PXN-222	ENST00000637624	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	MCM7	P33993	719 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	SATB1	Q01826	763 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	SCP2	P22307	547 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	RXRB	P28702	533 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	ASIC1	P78348	528 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	NELFB	Q8WX92	580 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	SPDL1	Q96EA4	605 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	PANX2	Q96RD6	677 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	EXOC1	Q9NV70	894 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	ATP5J	P18859	108 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	NR1D1	P20393	614 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CCDC155	Q8N6L0	562 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	FAM89A	Q96GI7	184 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	DONSON	Q9NYP3	566 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ18	B7U540	433 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	FOXN1	O15353	648 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	KCNJ12	Q14500	433 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	JAG2	Q9Y219	1238 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	MFAP3L	O75121	409 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PXN-222	ENST00000637624	CCDC93	Q567U6	631 aa		13.51	□□□□□ -0.25

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