RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 DHRS4Q9BTZ2 278 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGEF4Q9NR80 690 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.23□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 BLACEA4D250 179 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM170BA6NMN3 283 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 PPM1BO75688 479 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNH1O95259 989 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 RAPGEF3O95398 923 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 CAPNS1P04632 268 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 NCLP19338 710 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 MASP1P48740 699 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 PTPROQ16827 1216 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 DPY19L1Q2PZI1 675 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 OGFOD3Q6PK18 319 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 PAOXQ6QHF9 649 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 NSMFQ6X4W1 530 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 TXNRD3Q86VQ6 643 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 UBR7Q8N806 425 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 BTN2A2Q8WVV5 523 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 SGSM3Q96HU1 749 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FBXL18Q96ME1 805 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 TBC1D32Q96NH3 1257 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 NACC1Q96RE7 527 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC6Q99741 560 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM83CQ9BQN1 747 aa3.22□□□□□ -1.89
SPTAN1-232ENST00000636483 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TRAV20A0A0B4J274 112 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SHISA3A0PJX4 238 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 IQCA1LA6NCM1 817 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 AGRPO00253 132 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 NOP56O00567 594 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 DHX15O43143 795 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 DLX3O60479 287 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAJC6O75061 913 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SDSP20132 328 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 EVA1CP58658 441 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 AMPD3Q01432 767 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TCEA2Q15560 299 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 PRSS53Q2L4Q9 553 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF227Q86WZ6 799 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 CLEC10AQ8IUN9 316 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 FIBCD1Q8N539 461 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 GATA6Q92908 595 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 OSBP2Q969R2 916 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TP53INP1Q96A56 240 aa3.21□□□□□ -1.9
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SPTAN1-232ENST00000636483 IER2Q9BTL4 223 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 YIPF2Q9BWQ6 316 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 EPN3Q9H201 632 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SPC25Q9HBM1 224 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 GPRC5CQ9NQ84 441 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 WHRNQ9P202 907 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 STOML1Q9UBI4 398 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 EMC9Q9Y3B6 208 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 U3KQE9 123 aa3.21□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 H0Y8X5 98 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ARNTLO00327 626 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ITGA4P13612 1032 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 CYP7A1P22680 504 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ETV3P41162 512 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ECI1P42126 302 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 KCNJ6P48051 423 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 IGBP1P78318 339 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TNK2Q07912 1038 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 CYP4F3Q08477 520 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TMEM67Q5HYA8 995 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 SFRP5Q5T4F7 317 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 CNNM4Q6P4Q7 775 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ZAR1Q86SH2 424 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.2□□□□□ -1.9
SPTAN1-232ENST00000636483 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa3.2□□□□□ -1.9
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