RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636337.1

SPTAN1-231, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-231	ENST00000636337	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	MYADML2	A6NDP7	307 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLS1	Q14651	629 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	ACER1	Q8TDN7	264 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TINF2	Q9BSI4	451 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	MROH8	Q9H579	483 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	RAI14	Q9P0K7	980 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		12.1	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARVCF	O00192	962 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	DCX	O43602	365 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	PGK2	P07205	417 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	FCER1A	P12319	257 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	HIPK3	Q9H422	1215 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	TRIO	O75962	3097 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	FLT1	P17948	1338 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL16	Q14005	1332 aa		12.09	□□□□□ -0.47
SPTAN1-231	ENST00000636337	CIAO1	O76071	339 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ASGR1	P07306	291 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCL23	P55773	120 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	GRB10	Q13322	594 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	COG2	Q14746	738 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	CCDC27	Q2M243	656 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PI16	Q6UXB8	463 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		12.08	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	CD4	P01730	458 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	HLA-DOA	P06340	250 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL9	P15248	144 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	TIMM10	P62072	90 aa		12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	LPXN	O60711	386 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	TAP1	Q03518	808 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	MB21D1	Q8N884	522 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PRSS33	Q8NF86	280 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	MMP19	Q99542	508 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	FBXO3	Q9UK99	471 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.06	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	GFRA3	O60609	400 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	BAG3	O95817	575 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PLCG2	P16885	1265 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCNA5	P22460	613 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	TTLL4	Q14679	1199 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPATA5	Q8NB90	893 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	XAGE2	Q96GT9	111 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	USP44	Q9H0E7	712 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	PTPN5	P54829	565 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	KCTD2	Q14681	263 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	SPRED2	Q7Z698	418 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ATG4C	Q96DT6	458 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	SCLY	Q96I15	445 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	ZNF536	O15090	1300 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SPTAN1-231	ENST00000636337	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		12.03	□□□□□ -0.48

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