RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627393.1

PCNP-208, Transcript of PEST proteolytic signal containing nuclear protein, human

TSL 2 BASIC

Gene PCNP, Length 136 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCNP-208	ENST00000627393	AKR1A1	P14550	325 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CAP2	P40123	477 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	RIPK4	P57078	832 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	GCKR	Q14397	625 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	WDR18	Q9BV38	432 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	DMD	P11532	3685 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393		A0A1B0GUL7	405 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	LCHN	A4D1U4	455 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L15	C9J2P7	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L11	C9JVI0	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L18	D6R9N7	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L22	D6RA61	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L19	D6RCP7	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L20	D6RJB6	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CHL1	O00533	1208 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	MBTPS2	O43462	519 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CD4	P01730	458 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ASNS	P08243	561 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	TAL1	P17542	331 aa	Predicted RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	SDHB	P21912	280 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	KCNJ6	P48051	423 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L24	Q0WX57	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	TIGD5	Q53EQ6	642 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ZBTB33	Q86T24	672 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	BANK1	Q8NDB2	785 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	FBXO22	Q8NEZ5	403 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	BTBD7	Q9P203	1132 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	PTPRS	Q13332	1948 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.22	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.21	□□□□□ -1.73
PCNP-208	ENST00000627393	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	MYADML2	A6NDP7	307 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	NCK2	O43639	380 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	ADRB1	P08588	477 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	PRDX5	P30044	214 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	ERVK-21	P61565	698 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	RPAIN	Q86UA6	219 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	TMEM105	Q8N8V8	129 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	TINF2	Q9BSI4	451 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.21	□□□□□ -1.74
PCNP-208	ENST00000627393	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.21	□□□□□ -1.74

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