RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623129.1

C2orf27B-201, Transcript of chromosome 2 open reading frame 27B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C2orf27B, Length 1,325 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf27B-201ENST00000623129 ZNF543Q08ER8 600 aa20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RTN1Q16799 776 aa20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CCDC96Q2M329 555 aa20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 GNAQP50148 359 aa20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 C1QTNF8P60827 252 aa20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 ME3Q16798 604 aa20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RXRAP19793 462 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 MOGSQ13724 837 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CCL15Q16663 113 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 HSCBQ8IWL3 235 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.6■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 PTPRFP10586 1907 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 PLA2G6O60733 806 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 LARGE1O95461 756 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 INHBEP58166 350 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 STK3Q13188 491 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 NOGQ13253 232 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 DGKZQ13574 1117 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TMX3Q96JJ7 454 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CAPNS2Q96L46 248 aa20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L15C9J2P7 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L11C9JVI0 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 KLRF2D3W0D1 207 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L18D6R9N7 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L22D6RA61 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L19D6RCP7 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L20D6RJB6 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 HSPA6P17066 643 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 USP17L24Q0WX57 530 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 KCTD1Q719H9 257 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 FAM160B2Q86V87 743 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 GTF3C6Q969F1 213 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 GPCPD1Q9NPB8 672 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 FEM1BQ9UK73 627 aa20.58■□□□□ 0.89
C2orf27B-201ENST00000623129 TMEM232C9JQI7 657 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SMARCA1P28370 1054 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 STAT2P52630 851 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SREBF2Q12772 1141 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 TMTC3Q6ZXV5 915 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.57■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CPLX1O14810 134 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CDC27P30260 824 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SCRN1Q12765 414 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 BECN1Q14457 450 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 TREML2Q5T2D2 321 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 GPAT2Q6NUI2 795 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 NECAB1Q8N987 351 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 MYPNQ86TC9 1320 aa20.56■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 CDKL5O76039 1030 aa20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 GRM1Q13255 1194 aa20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 TTBK2Q6IQ55 1244 aa20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
C2orf27B-201ENST00000623129 BTBD19C9JJ37 291 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms