RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CU633980.1-201ENST00000613894 MDH1P40925 334 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KRT83P78385 493 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TNNI3KQ59H18 835 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ARMC9Q7Z3E5 817 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 SLF1Q9BQI6 1058 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 EBF2Q9HAK2 575 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa12.7□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 C5orf60A6NFR6 353 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GOLGA8BA8MQT2 603 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PTPREP23469 700 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TEFQ10587 303 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TRAF1Q13077 416 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 IQCKQ8N0W5 287 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC26Q8TAB7 109 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CAGE1Q8TC20 777 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CPLX3Q8WVH0 158 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ABCA3Q99758 1704 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 NRAPQ86VF7 1730 aa12.69□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PES1O00541 588 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CPLX1O14810 134 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PDHBP11177 359 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HERVK_113P62684 666 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RIPK1Q13546 671 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KRT40Q6A162 431 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CEP57Q86XR8 500 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCHCR1Q8TD31 782 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 DNAJC7Q99615 494 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HDAC6Q9UBN7 1215 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GUCA1BQ9UMX6 200 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PIK3C2AO00443 1686 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KRT86O43790 486 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 NR1D1P20393 614 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PRPHP41219 470 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP2B2Q01814 1243 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 IFT88Q13099 833 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 NAA25Q14CX7 972 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 OR8K1Q8NGG5 319 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CYFIP2Q96F07 1278 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ZIM3Q96PE6 472 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ALG1Q9BT22 464 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RABEP2Q9H5N1 569 aa12.68□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 UBN2Q6ZU65 1347 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 STK36Q9NRP7 1315 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 A0A0G2JS52 829 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PPFIA3O75145 1194 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ZMYND10O75800 440 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GCKP35557 465 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 MEA1Q16626 185 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 STK11IPQ8N1F8 1099 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 RASSF8Q8NHQ8 419 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CAMKK2Q96RR4 588 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CENPHQ9H3R5 247 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PHF8Q9UPP1 1060 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ACEP12821 1306 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 HEG1Q9ULI3 1381 aa12.67□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PRC1O43663 620 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PAEPP09466 180 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 KRT9P35527 623 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 COPB1P53618 953 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ZNF827Q17R98 1081 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 CCDC122Q5T0U0 273 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 LMBR1Q8WVP7 490 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 GSDMAQ96QA5 445 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 TSGA10Q9BZW7 698 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 STIM2Q9P246 746 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 SNX12Q9UMY4 172 aa12.66□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 A0A1W2PQC6 194 aa12.65□□□□□ -0.38
CU633980.1-201ENST00000613894 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.1 ms