RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602511.1

KDM5B-210, Transcript of lysine demethylase 5B, humanhuman

TSL 5

Gene KDM5B, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5B-210ENST00000602511 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 A0A0G2JMZ2 1700 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PTPDC1A2A3K4 754 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FAM196BA6NMK8 535 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CTDNEP1O95476 244 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PDHBP11177 359 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 EEF2P13639 858 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CDC27P30260 824 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SEPT2Q15019 361 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 TMTC3Q6ZXV5 915 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MIGA2Q7L4E1 593 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FAM184AQ8NB25 1140 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 GMCL1Q96IK5 515 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SPZ1Q9BXG8 430 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 GOPCQ9HD26 462 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 TSKSQ9UJT2 592 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 TMX2Q9Y320 296 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa9.51□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MAP3K13O43283 966 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PLA2G6O60733 806 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 GABBR2O75899 941 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 GDF11O95390 407 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 DEXIO95424 95 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ADD1P35611 737 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 IREB2P48200 963 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FKBP1BP68106 108 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF543Q08ER8 600 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FUT2Q10981 343 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 RAB3GAP1Q15042 981 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 NBPF11Q86T75 865 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 LPAR1Q92633 364 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CDCA5Q96FF9 252 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 WRNIP1Q96S55 665 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MYL10Q9BUA6 226 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 WDR18Q9BV38 432 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MAD2L2Q9UI95 211 aa9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 USP17L5A8MUK1 530 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 hCG_1984214I3L0E3 225 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 STX6O43752 255 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 BRD1O95696 1058 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 POTEIP0CG38 1075 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 POTEJP0CG39 1038 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SYT1P21579 422 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 USP14P54578 494 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SIAH1Q8IUQ4 282 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 VCPKMTQ9H867 229 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PICK1Q9NRD5 415 aa9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 TMEM88BA6NKF7 163 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ADM5C9JUS6 153 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 JAK2O60674 1132 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 USP2O75604 605 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SLURP2P0DP57 97 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 FDPSP14324 419 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 XBP1P17861 261 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PTPRAP18433 802 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 RXRAP19793 462 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 JAG1P78504 1218 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MAP3K9P80192 1104 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 DGKZQ13574 1117 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 BTNL9Q6UXG8 535 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CLEC17AQ6ZS10 378 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ARMC9Q7Z3E5 817 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 TEX2Q8IWB9 1127 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 MS4A3Q96HJ5 214 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 C12orf42Q96LP6 360 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 RIOX1Q9H6W3 641 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 CSADQ9Y600 493 aa9.48□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 A0A1W2PRG0 241 aa9.47□□□□□ -0.89
KDM5B-210ENST00000602511 C19orf81C9J6K1 198 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms