RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 NUP98P52948 1817 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6CA6NDK9 693 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6DP0CG33 693 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 SLC8A1P32418 973 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GCKP35557 465 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 SCRN1Q12765 414 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM259Q4ZIN3 620 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 HLA-CQ95604 372 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 NDUFAB1O14561 156 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 GPAA1O43292 621 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 YEATS4O95619 227 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CSF1RP07333 972 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 CCT5P48643 541 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 OXER1Q8TDS5 423 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 SH3GL3Q99963 347 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PNMA3Q9UL41 463 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 FAM169AQ9Y6X4 670 aa6.71□□□□□ -1.33
SEH1L-210ENST00000592582 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 SETSIPP0DME0 302 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FDX1P10109 184 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ZAP70P43403 619 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FANCCQ00597 558 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 NLRP10Q86W26 655 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 VPS37DQ86XT2 251 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ARMC2Q8NEN0 867 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 BCAS4Q8TDM0 211 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 PIGBQ92521 554 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 HAND2P61296 217 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 STIM1Q13586 685 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CASP8Q14790 479 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FBXL16Q8N461 479 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 A0A1W2PQ27 194 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 A0A1W2PQ64 194 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 A0A1W2PQD8 194 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 RCCD1A6NED2 376 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ZBTB43O43298 467 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 IARSP41252 1262 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 PPFIA1Q13136 1202 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 IQCB1Q15051 598 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 LRRN4Q8WUT4 740 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC114Q96M63 670 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ASAP1Q9ULH1 1129 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 SLC12A7Q9Y666 1083 aa6.71□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA6L10A6NI86 522 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 PDE8BO95263 885 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CRYMQ14894 314 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 IQCA1Q86XH1 822 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 NBPF3Q9H094 633 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 RTEL1Q9NZ71 1219 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CDC23Q9UJX2 597 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 SPTLC2O15270 562 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FGAP02671 866 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 FAM173BQ6P4H8 233 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 LRRC31Q6UY01 552 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 REXO1L1PQ8IX06 675 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 OSBP2Q969R2 916 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 M0R2C6 588 aa6.7□□□□□ -1.34
SEH1L-210ENST00000592582 STX10O60499 249 aa6.7□□□□□ -1.34
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