RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590694.5

NEDD4L-231, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5

Gene NEDD4L, Length 165 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-231	ENST00000590694	SHOX	O15266	292 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	EOMES	O95936	686 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM153B	P0C7A2	387 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CD247	P20963	164 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CHRNA4	P43681	627 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FGD4	Q96M96	766 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	WHRN	Q9P202	907 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		7.51	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A1W2PQU0	124 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPM1B	O75688	479 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CD163	Q86VB7	1156 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	GP6	Q9HCN6	339 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		7.5	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	LEFTY1	O75610	366 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITGAV	P06756	1048 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM87A	P0C7U9	286 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ITGA4	P13612	1032 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF227	Q86WZ6	799 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	DCAF5	Q96JK2	942 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FEZ1	Q99689	392 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	WIZ	O95785	1651 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PPP2R2A	P63151	447 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TCEA2	Q15560	299 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	BVES	Q8NE79	360 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.48	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694		A0A087WZG4	1122 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ASMTL	O95671	621 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TKFC	Q3LXA3	575 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	SFRP5	Q5T4F7	317 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZAR1	Q86SH2	424 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	GATA6	Q92908	595 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRR13	Q9NZ81	148 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		7.47	□□□□□ -1.21
NEDD4L-231	ENST00000590694	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	HMX2	A2RU54	273 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	LRRN2	O75325	713 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	KIR3DL1	P43629	444 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	ZNF445	P59923	1031 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	FAM214B	Q7L5A3	538 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	CDC6	Q99741	560 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	LGR4	Q9BXB1	951 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	AKT3	Q9Y243	479 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	EMC9	Q9Y3B6	208 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		7.46	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	ADM	P35318	185 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	GATA4	P43694	442 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	GYS2	P54840	703 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		7.45	□□□□□ -1.22
NEDD4L-231	ENST00000590694	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		7.45	□□□□□ -1.22

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