RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 PSMD14O00487 310 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 USP17L2Q6R6M4 530 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 MMP14P50281 582 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 CACNB3P54284 484 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 STX1AQ16623 288 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 RIOX1Q9H6W3 641 aa25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 RAD17O75943 681 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 SPDYE6P0CI01 402 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 SLC35G1Q2M3R5 365 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 FERMT2Q96AC1 680 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 ANO10Q9NW15 660 aa25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 USP17L5A8MUK1 530 aa25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 DLGAP5Q15398 846 aa25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 TTC38Q5R3I4 469 aa25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 WWC2Q6AWC2 1192 aa25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.64■■□□□ 1.7
USP36-218ENST00000590546 STXBP3O00186 592 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 HS1BP3Q53T59 392 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.699e-6■■□□□ 14.5
USP36-218ENST00000590546 MKL1Q969V6 931 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 DNAJC18Q9H819 358 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 NYAP2Q9P242 653 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.64■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ATP2B1P20020 1258 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 GNA11P29992 359 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CLIC6Q96NY7 704 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 TAOK3Q9H2K8 898 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 KCNH3Q9ULD8 1083 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.63■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.62■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.62■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 SIPA1L1O43166 1804 aa25.62■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ZNF165P49910 485 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 JDP2Q8WYK2 163 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 C6orf50Q9HD87 102 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 FAM205CA6NFA0 338 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 M0R2N6 131 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ZNF543Q08ER8 600 aa25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa25.6■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ESYT2A0FGR8 921 aa25.6■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 NAPAP54920 295 aa25.6■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CBX8Q9HC52 389 aa25.6■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 FAM151AQ8WW52 585 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CCDC34Q96HJ3 373 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 COL4A5P29400 1685 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 SPDYE2Q495Y8 402 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CSRNP1Q96S65 589 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa25.59■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 CIAPIN1Q6FI81 312 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 KANK3Q6NY19 840 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 HOMER1Q86YM7 354 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 DCAF4Q8WV16 495 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 PIGSQ96S52 555 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 USP25Q9UHP3 1055 aa25.58■■□□□ 1.69
USP36-218ENST00000590546 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.58■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 MYO1BO43795 1136 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 ATP2B2Q01814 1243 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 CXCL9Q07325 125 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 TNIP1Q15025 636 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 ZNF174Q15697 407 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.57■■□□□ 1.68
USP36-218ENST00000590546 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms