RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590105.1

EFTUD2-216, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-216ENST00000590105 ALDH1B1P30837 517 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 IRS1P35568 1242 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RASSF7Q02833 373 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SLC10A5Q5PT55 438 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GORABQ5T7V8 394 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SUSD4Q5VX71 490 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 IER5Q5VY09 327 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SVOPQ8N4V2 548 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 MASTLQ96GX5 879 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM74Q96NL1 305 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 C10orf71Q711Q0 1435 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 C4AP0C0L4 1744 aa9.61□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 KDM3BQ7LBC6 1761 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SRGNP10124 158 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CENPCQ03188 943 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 STYK1Q6J9G0 422 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 HOMER1Q86YM7 354 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TSPYL6Q8N831 410 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GINM1Q9NU53 330 aa9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PHACTR2O75167 634 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 VAMP4O75379 141 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 S100BP04271 92 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NPR1P16066 1061 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 AMPD3Q01432 767 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 TNNI3KQ59H18 835 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SH3TC2Q8TF17 1288 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP3Q96P20 1036 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 STK31Q9BXU1 1019 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 FANCLQ9NW38 375 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 MSRB2Q9Y3D2 182 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.59□□□□□ -0.87
EFTUD2-216ENST00000590105 CHD4Q14839 1912 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 DDX58O95786 925 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF438Q7Z4V0 828 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 NLRP10Q86W26 655 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 PMEPA1Q969W9 287 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 ISCA1Q9BUE6 129 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 PPM1HQ9ULR3 514 aa9.58□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 KIF13BQ9NQT8 1826 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 FAM221BA6H8Z2 402 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GPR25O00155 361 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GDF11O95390 407 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 KSR2Q6VAB6 950 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 TMEM151AQ8N4L1 468 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 STAG1Q8WVM7 1258 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 NPHS2Q9NP85 383 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.57□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 MEN1O00255 615 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 NTSR2O95665 410 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GYS2P54840 703 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 DBN1Q16643 649 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 ELP3Q9H9T3 547 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 NUP98P52948 1817 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 RNF123Q5XPI4 1314 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 UBN2Q6ZU65 1347 aa9.56□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 GREM1O60565 184 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 BBOX1O75936 387 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 PDGFRBP09619 1106 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 SLFN5Q08AF3 891 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.55□□□□□ -0.88
EFTUD2-216ENST00000590105 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.3 ms