RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 OVOS1Q6IE37 1185 aa8.21□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LETMD1Q6P1Q0 360 aa8.21□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa8.21□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.21□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PHACTR4Q8IZ21 702 aa8.21□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FGD6Q6ZV73 1430 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP27A1Q02318 531 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARID5AQ03989 594 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDH24Q86UP0 819 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC51AQ86UW1 340 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ATG4CQ96DT6 458 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MIA2Q96PC5 1412 aa8.2□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EOMESO95936 686 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IMPDH2P12268 514 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP27C1Q4G0S4 372 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC43A3Q8NBI5 491 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CRBNQ96SW2 442 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIF2CQ99661 725 aa8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MROH2AA6NES4 1674 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRR19A6NJB7 356 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ADAM23O75077 832 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TGFB1P01137 390 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RAG1P15918 1043 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C8orf37Q96NL8 207 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PREX1Q8TCU6 1659 aa8.18□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MEIS3P2A8K0S8 358 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF6P56537 245 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CDCP2Q5VXM1 449 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM214BQ7L5A3 538 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CNNM2Q9H8M5 875 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PIM2Q9P1W9 311 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP131Q9UPN4 1083 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DAPK1P53355 1430 aa8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM86C2PA6NEL3 165 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CEP152O94986 1710 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 NME1P15531 152 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GBP1P32455 592 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZMYM3Q14202 1370 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MCF2L2Q86YR7 1114 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SHDQ96IW2 340 aa8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 RGS13O14921 159 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CYP26A1O43174 497 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FGRP09769 529 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GIPRP48546 466 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GGT6Q6P531 493 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DNAJB8Q8NHS0 232 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SLC9A7Q96T83 725 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GMLQ99445 158 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 U3KQE9 123 aa8.15□□□□□ -1.1
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYO3AQ8NEV4 1616 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ABCC3O15438 1527 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SHANK2Q9UPX8 1470 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 UBOX5O94941 541 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ACRP10323 421 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TM9SF2Q99805 663 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 DEPDC5O75140 1603 aa8.14□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TNFRSF10CO14798 259 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 KIF3BO15066 747 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 CBX7O95931 251 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FOSL1P15407 271 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms