RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa18.35■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 CYP21A2P08686 494 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 FLT3LGP49771 235 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 ATP2B2Q01814 1243 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 PXYLP1Q8TE99 480 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 ATG4CQ96DT6 458 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 GMCL1Q96IK5 515 aa18.34■□□□□ 0.53
BECN1-211ENST00000589636 VWA5AO00534 786 aa18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 MAPK4P31152 587 aa18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SHCBP1Q8NEM2 672 aa18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZSWIM5Q9P217 1185 aa18.33■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ATP2A1O14983 1001 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 FLOT1O75955 427 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 NECTIN1Q15223 517 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLFN13Q68D06 897 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 GPR142Q7Z601 462 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 DGKHQ86XP1 1220 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ESR2Q92731 530 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 COA7Q96BR5 231 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TMEM47Q9BQJ4 181 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SPATC1LQ9H0A9 340 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TAF6LQ9Y6J9 622 aa18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.31■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SNHG28P0DPA3 235 aa18.31■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 GRK4P32298 578 aa18.31■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.31■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 BRCA2P51587 3418 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 HOXC6P09630 235 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 BMP3P12645 472 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 PTPREP23469 700 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 CCNA1P78396 465 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 BTNL9Q6UXG8 535 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 PLEKHH3Q7Z736 793 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLF1Q9BQI6 1058 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 FEM1BQ9UK73 627 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 STX8Q9UNK0 236 aa18.3■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 B4E1Z4 1266 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 KDM4AO75164 1064 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SEC23AQ15436 765 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 NBPF11Q86T75 865 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RIOX2Q8IUF8 465 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLAIN1Q8ND83 568 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SH3TC2Q8TF17 1288 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 KRT23Q9C075 422 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 STRNO43815 780 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ADCY3O60266 1144 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 MCCP23508 829 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 GRB14Q14449 540 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RAET1EQ8TD07 263 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.28■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 E7EWF7 191 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 FDX1P10109 184 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ERCC3P19447 782 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 RASGRP2Q7LDG7 609 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 DCAF4Q8WV16 495 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 MROH8Q9H579 483 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 TOMM22Q9NS69 142 aa18.27■□□□□ 0.52
BECN1-211ENST00000589636 ZNF536O15090 1300 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 TMEM232C9JQI7 657 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 CDC45O75419 566 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 SLC25A27O95847 323 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 PDHBP11177 359 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 STAT3P40763 770 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 SLC1A4P43007 532 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 OAZ1P54368 228 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 MAP2K5Q13163 448 aa18.26■□□□□ 0.51
BECN1-211ENST00000589636 MTFR1Q15390 333 aa18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms