RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 F5H6K3 240 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 KLRC3Q07444 240 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TRIM32Q13049 653 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 GRB14Q14449 540 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CEP95Q96GE4 821 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 HOXC6P09630 235 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TSPY3P0CV98 308 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TSPY8P0CW00 308 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.99■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 RAD21O60216 631 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TTLL1O95922 423 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 SDSP20132 328 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TFAP4Q01664 338 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 MROH8Q9H579 483 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.98■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 NDUFB10O96000 172 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FGAP02671 866 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ERCC3P19447 782 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CCL14Q16627 93 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.97■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ZMYM6O95789 1325 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CCDC171Q6TFL3 1326 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 VWA5AO00534 786 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A27O95847 323 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FGRP09769 529 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 PLS1Q14651 629 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.96■■□□□ 1.43
GIPC1-211ENST00000589631 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 HIP1O00291 1037 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ORC4O43929 436 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 INCENPQ9NQS7 918 aa23.94■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 TSPY2A6NKD2 308 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 IGHA2P01877 340 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ADORA2AP29274 412 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 STAT3P40763 770 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 DPP9Q86TI2 863 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 REPS2Q8NFH8 660 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.93■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 COPB2P35606 906 aa23.92■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.92■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.92■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 FCER1AP12319 257 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 NOVP48745 357 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 OLFML2BQ68BL8 750 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 SLFN13Q68D06 897 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 FEM1BQ9UK73 627 aa23.91■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 COBLO75128 1261 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 PCP11498 1178 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 PDE4AP27815 886 aa23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
GIPC1-211ENST00000589631 ATP2A1O14983 1001 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 BMP3P12645 472 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 DPF3Q92784 378 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 GMCL1Q96IK5 515 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 STX8Q9UNK0 236 aa23.89■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 ZBED4O75132 1171 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 FDX1P10109 184 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 LHX8Q68G74 356 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.88■■□□□ 1.41
GIPC1-211ENST00000589631 NMT2O60551 498 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.7 ms