RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ASB2Q96Q27 587 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.824e-6■□□□□ 9.2
CAPNS1-205ENST00000588780 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 SH2D4AQ9H788 454 aa26.41■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 APBB1O00213 710 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TIMP1P01033 207 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TRIM27P14373 513 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 IGFBP4P22692 258 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ACLYP53396 1101 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM122AQ96E09 287 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TOX2Q96NM4 488 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TNNQ9UQP3 1299 aa26.4■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 MYO9BQ13459 2157 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 GRXCR1A8MXD5 290 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PBX2P40425 430 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP26.39■■□□□ 1.822e-7■□□□□ 8.5
CAPNS1-205ENST00000588780 POLA2Q14181 598 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM132BQ14DG7 1078 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
CAPNS1-205ENST00000588780 RAD21O60216 631 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ICA1Q05084 483 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 GABPAQ06546 454 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 PBX4Q9BYU1 374 aa26.38■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ATP8B2P98198 1209 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 EVX2Q03828 476 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0G2JMZ2 1700 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 WDR46O15213 610 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 PLA2G5P39877 138 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 MFSD5Q6N075 450 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SSH3Q8TE77 659 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 VCPKMTQ9H867 229 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 MSRAQ9UJ68 235 aa26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 MOXD2PA6NHM9 499 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ADAMTS4O75173 837 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 STAT3P40763 770 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 KCNA10Q16322 511 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM199Q8N511 208 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SWAP70Q9UH65 585 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM184BQ9ULE4 1060 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TMX2Q9Y320 296 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 MROH7Q68CQ1 1323 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.35■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 ACRP10323 421 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 CYP2D6P10635 497 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM240Q5SV17 173 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 RIOX2Q8IUF8 465 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SDR42E1Q8WUS8 393 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 DYNLL2Q96FJ2 89 aa26.34■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 AKR1B1P15121 316 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 CSF2RAP15509 400 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 TBX21Q9UL17 535 aa26.33■■□□□ 1.81
CAPNS1-205ENST00000588780 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC4A3P48751 1232 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 RAB30Q15771 203 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ZNF365Q70YC5 407 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 DDX11Q96FC9 970 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SPC25Q9HBM1 224 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 ROBO3Q96MS0 1386 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.32■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 COPB2P35606 906 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 AACSQ86V21 672 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 MICALL1Q8N3F8 863 aa26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 TLR3O15455 904 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 PDE6AP16499 860 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC28A3Q9HAS3 691 aa26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CAPNS1-205ENST00000588780 NCOR1O75376 2440 aa26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.1 ms