RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF236Q9UL36 1845 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SURF6O75683 361 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1A1P14550 325 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.07□□□□□ -0.641e-7■■□□□ 13.5
PTPRM-210ENST00000578916 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D4AQ9H788 454 aa11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 GRXCR1A8MXD5 290 aa11.06□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 PGK2P07205 417 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 IGFBP4P22692 258 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 PBX2P40425 430 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ACLYP53396 1101 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 GABPAQ06546 454 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 KCTD2Q14681 263 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM132BQ14DG7 1078 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MFSD5Q6N075 450 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM179Q6ZVK1 233 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SPICE1Q8N0Z3 855 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 PBX4Q9BYU1 374 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MSRAQ9UJ68 235 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 FOCADQ5VW36 1801 aa11.06□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MOXD2PA6NHM9 499 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 WDR46O15213 610 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 POLA2Q14181 598 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF792Q3KQV3 632 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM240Q5SV17 173 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM199Q8N511 208 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 VTI1AQ96AJ9 217 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 VCPKMTQ9H867 229 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MCM9Q9NXL9 1143 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TBX21Q9UL17 535 aa11.05□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.05□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 APBB1O00213 710 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 BCAR3O75815 825 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM27P14373 513 aa11.04□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 ICA1Q05084 483 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ADGRE1Q14246 886 aa11.04□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 RIOX2Q8IUF8 465 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 KLHDC9Q8NEP7 349 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SSH3Q8TE77 659 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 GLT1D1Q96MS3 346 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 FAM184BQ9ULE4 1060 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TMX2Q9Y320 296 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa11.04□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MYH1P12882 1939 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ACRP10323 421 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 CSF2RAP15509 400 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 COPB2P35606 906 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 EVX2Q03828 476 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 RASIP1Q5U651 963 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF365Q70YC5 407 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.03□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
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PTPRM-210ENST00000578916 SWAP70Q9UH65 585 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 TNNQ9UQP3 1299 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 ELP1O95163 1332 aa11.03□□□□□ -0.64
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0G2JMZ2 1700 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 VWA5AO00534 786 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 RAD21O60216 631 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 CYP2D6P10635 497 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 AKR1B1P15121 316 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 CDK7P50613 346 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.02□□□□□ -0.65
PTPRM-210ENST00000578916 CLEC10AQ8IUN9 316 aa11.02□□□□□ -0.65
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