RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 ADAMTS20P59510 1910 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ANKRD62A6NC57 917 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PSPNO60542 156 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO24O75426 580 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ERCC3P19447 782 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 RALBP1Q15311 655 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 DNAJB8Q8NHS0 232 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 FEZF2Q8TBJ5 459 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 GAL3ST3Q96A11 431 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SHISA4Q96DD7 197 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 SIRT5Q9NXA8 310 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 CEP131Q9UPN4 1083 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRM-204ENST00000577468 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 GFRA2O00451 464 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 N4BP3O15049 544 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CELA3AP09093 270 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MMP14P50281 582 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PLCB3Q01970 1234 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CASC1Q6TDU7 716 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TMC7Q7Z402 723 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 DTWD2Q8NBA8 298 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 FBF1Q8TES7 1133 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TJP2Q9UDY2 1190 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TTC36A6NLP5 189 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CALRP27797 417 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PLP2Q04941 152 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 DSC3Q14574 896 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ADGRF1Q5T601 910 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 OLFML2BQ68BL8 750 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RINLQ6ZS11 566 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SV2BQ7L1I2 683 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 NLRX1Q86UT6 975 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM87BQ96K49 555 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CRTAC1Q9NQ79 661 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ABLIM1O14639 778 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ANP32CO43423 234 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PGRP06401 933 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 INSRRP14616 1297 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CDK8P49336 464 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RPS26P62854 115 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TEKQ02763 1124 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PDE4BQ07343 736 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CNKSR3Q6P9H4 555 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TXNDC2Q86VQ3 553 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 NME8Q8N427 588 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 OSBPL7Q9BZF2 842 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CNTD2Q9H8S5 307 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 IGSF5Q9NSI5 407 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 EBF1Q9UH73 591 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF281Q9Y2X9 895 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 UNCXA6NJT0 531 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 NOTOA8MTQ0 251 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TREHO43280 583 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 CILPO75339 1184 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 APPP05067 770 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 EPHB3P54753 998 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MYBPC2Q14324 1141 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 LONRF3Q496Y0 759 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 TTBK2Q6IQ55 1244 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 LINC01356Q8N9X3 169 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 MORC4Q8TE76 937 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RNF141Q8WVD5 230 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 GPR20Q99678 358 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 UBA5Q9GZZ9 404 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 HDAC5Q9UQL6 1122 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 RRP9O43818 475 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 NRDCO43847 1150 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 LMNB1P20700 586 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 VIPR1P32241 457 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 GALK1P51570 392 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 SLC14A2Q15849 920 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRM-204ENST00000577468 VMACQ2NL98 169 aa3.92□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms