RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 KMT5BQ4FZB7 885 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 CREBRFQ8IUR6 639 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 BLIDQ8IZY5 108 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 ATRIPQ8WXE1 791 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 LAMB1P07942 1786 aa24.08■■□□□ 1.45
TMEM260-216ENST00000557657 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 KIF5BP33176 963 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.07■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 SYCP1Q15431 976 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 A0A1B0GTH6 734 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 INF2Q27J81 1249 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 SPATA1Q5VX52 437 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ERO1AQ96HE7 468 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 L2HGDHQ9H9P8 463 aa24.06■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 UFL1O94874 794 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC93Q567U6 631 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 SOWAHDA6NJG2 315 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 MYO1BO43795 1136 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 BTDP43251 543 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 DGKHQ86XP1 1220 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 WDR24Q96S15 920 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 GDAQ9Y2T3 454 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 SBF2Q86WG5 1849 aa24.05■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ARHGAP6O43182 974 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 BMP15O95972 392 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RASA1P20936 1047 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RBL2Q08999 1139 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 IQUBQ8NA54 791 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 GSDMAQ96QA5 445 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 GRM4Q14833 912 aa24.04■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 LEMD3Q9Y2U8 911 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 URI1O94763 535 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 LRRC15Q8TF66 581 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CD209Q9NNX6 404 aa24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RGL2O15211 777 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 IGSF22Q8N9C0 903 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
TMEM260-216ENST00000557657 M0R2N6 131 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 BAG3O95817 575 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 IGSF3O75054 1194 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 VPS16Q9H269 839 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 EPC1Q9H2F5 836 aa24.01■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 STXBP3O00186 592 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 TRAPPC10P48553 1259 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 EEF2KMTQ96G04 330 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 TRIM49BA6NDI0 452 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 CALML3P27482 149 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 CDK8P49336 464 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 GNG11P61952 73 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 NAALADL2Q58DX5 795 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 RAD9BQ6WBX8 426 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 TEX11Q8IYF3 940 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 KLRF2D3W0D1 207 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 STX10O60499 249 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 POLLQ9UGP5 575 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 CASP14P31944 242 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 STAT6P42226 847 aa23.99■■□□□ 1.43
TMEM260-216ENST00000557657 PPP4CP60510 307 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms