RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 MYLIPQ8WY64 445 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FERMT2Q96AC1 680 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MMP19Q99542 508 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TINF2Q9BSI4 451 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 KANSL2Q9H9L4 492 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DDX19BQ9UMR2 479 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 AKR1A1P14550 325 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PDE6AP16499 860 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 STAT3P40763 770 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ICA1Q05084 483 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FPGSQ05932 587 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF792Q3KQV3 632 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 ATG4CQ96DT6 458 aa8.25□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 GOPCQ9HD26 462 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CNPY2Q9Y2B0 182 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 A0A1W2PQY0 241 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MOXD2PA6NHM9 499 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 VWA5AO00534 786 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ITGB8P26012 769 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TMEM132BQ14DG7 1078 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF576Q9H609 170 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 STARD7Q9NQZ5 370 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ELP1O95163 1332 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MROH7Q68CQ1 1323 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 TIMP1P01033 207 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 EEF2P13639 858 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 AKR1B1P15121 316 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DNAJB2P25686 324 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CDK8P49336 464 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FAAP100Q0VG06 881 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 C12orf60Q5U649 245 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 LCORLQ8N3X6 602 aa8.23□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 RHPN1Q8TCX5 695 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 KIF1BPQ96EK5 621 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SPC25Q9HBM1 224 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 FOCADQ5VW36 1801 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF236Q9UL36 1845 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 USP17L12C9JPN9 530 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 USP17L21D6R901 530 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 GOLIM4O00461 696 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ATP2A1O14983 1001 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ADAMTS4O75173 837 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 HMMRO75330 724 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PGK2P07205 417 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 CST5P28325 142 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ACLYP53396 1101 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 EPHB4P54760 987 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.091e-7■■□□□ 12.1
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CS-233ENST00000552688 MFSD5Q6N075 450 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
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CS-233ENST00000552688 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TIFAQ96CG3 184 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DDX11Q96FC9 970 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 GLT1D1Q96MS3 346 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 TEX13BQ9BXU2 312 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-233ENST00000552688 ARMT1Q9H993 441 aa8.22□□□□□ -1.09
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