RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 SPP2Q13103 211 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SH3D19Q5HYK7 790 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 FAM160B2Q86V87 743 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CCDC102AQ96A19 550 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PTPRFP10586 1907 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SLURP2P0DP57 97 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PDHBP11177 359 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 XBP1P17861 261 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 GTF2A2P52657 109 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 HUNKP57058 714 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 INHBEP58166 350 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 JAG1P78504 1218 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ZNF543Q08ER8 600 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SNAPC2Q13487 334 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CST9Q5W186 159 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TEX2Q8IWB9 1127 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 NKX2-3Q8TAU0 364 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SPZ1Q9BXG8 430 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ELP3Q9H9T3 547 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 FEM1BQ9UK73 627 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SMC3Q9UQE7 1217 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 MYPNQ86TC9 1320 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 STK36Q9NRP7 1315 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PRG0 241 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 KLRF2D3W0D1 207 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 hCG_1984214I3L0E3 225 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 RAD21O60216 631 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 NDUFB10O96000 172 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CETPP11597 493 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CCT2P78371 535 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SCRN1Q12765 414 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 STK3Q13188 491 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 MTMR2Q13614 643 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CCDC96Q2M329 555 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 RGMBQ6NW40 437 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 BTNL9Q6UXG8 535 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TMTC3Q6ZXV5 915 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 OPTNQ96CV9 577 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SENP2Q9HC62 589 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 MAD2L2Q9UI95 211 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TLL2Q9Y6L7 1015 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TRIM75PA6NK02 468 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L15C9J2P7 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L11C9JVI0 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L18D6R9N7 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L22D6RA61 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L19D6RCP7 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L20D6RJB6 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 DEXIO95424 95 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ECE1P42892 770 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 STAT2P52630 851 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 USP17L24Q0WX57 530 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SAPCD2Q86UD0 394 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CCDC83Q8IWF9 413 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ACER1Q8TDN7 264 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 OTUD5Q96G74 571 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 WNK4Q96J92 1243 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 MYL10Q9BUA6 226 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 HOXC10Q9NYD6 342 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 PNMA3Q9UL41 463 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 IRF6O14896 467 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 APLP1P51693 650 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 HMGCS2P54868 508 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 IKQ13123 557 aaPredicted RBP10.79□□□□□ -0.68
CS-220ENST00000550700 TRIM29Q14134 588 aa10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms