RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 CA8P35219 290 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SIK1P57059 783 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ADPGKQ9BRR6 497 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 CCT6BQ92526 530 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 USH1CQ9Y6N9 552 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ERCC6L2Q5T890 1561 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 DLC1Q96QB1 1528 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF75DP51815 510 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.41□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 METP08581 1390 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 CDC25BP30305 580 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 BTDP43251 543 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP9.4□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC63Q8NA47 563 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRB-208ENST00000550358 IL17REQ8NFR9 667 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 CCDC93Q567U6 631 aa9.4□□□□□ -0.9
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PTPRB-208ENST00000550358 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 RNF34Q969K3 372 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 AMNQ9BXJ7 453 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 USP44Q9H0E7 712 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 FAM114A2Q9NRY5 505 aa9.4□□□□□ -0.91
PTPRB-208ENST00000550358 RXRBP28702 533 aa9.4□□□□□ -0.91
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