RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 BMP3P12645 472 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SMARCA1P28370 1054 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 BACE1P56817 501 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FSTL1Q12841 308 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SPP2Q13103 211 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PPIL2Q13356 520 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 MTMR2Q13614 643 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa13.91□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 TRIM75PA6NK02 468 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 PLEKHA8P1O95397 391 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CTDNEP1O95476 244 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 GJB2P29033 226 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 NTRK3Q16288 839 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CST9Q5W186 159 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 STAG2Q8N3U4 1231 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 FAM184AQ8NB25 1140 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 OTUD5Q96G74 571 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 C12orf42Q96LP6 360 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 SPZ1Q9BXG8 430 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 TMOD4Q9NZQ9 345 aa13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
LMO3-218ENST00000538020 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa13.9□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CXCL11O14625 94 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 GOLGA8HP0CJ92 632 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PDCP20941 246 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 IKQ13123 557 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SH3D19Q5HYK7 790 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 KCTD1Q719H9 257 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RASGRP2Q7LDG7 609 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 WASF1Q92558 559 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 OPTNQ96CV9 577 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 GPCPD1Q9NPB8 672 aa13.89□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 JAK2O60674 1132 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PLA2G6O60733 806 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 DEXIO95424 95 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 STAT2P52630 851 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 HMGCS2P54868 508 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 HUNKP57058 714 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FUT2Q10981 343 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FAM83BQ5T0W9 1011 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 NBPF11Q86T75 865 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FAM160B2Q86V87 743 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CCDC82Q8N4S0 544 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CHURC1Q8WUH1 139 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PHKBQ93100 1093 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 DDX11Q96FC9 970 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 FEM1BQ9UK73 627 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 KCNH4Q9UQ05 1017 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PTPRFP10586 1907 aa13.88□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TMEM232C9JQI7 657 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 IRF6O14896 467 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 VCAM1P19320 739 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 BTNL9Q6UXG8 535 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 WNK4Q96J92 1243 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RIOX1Q9H6W3 641 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 MYH6P13533 1939 aa13.87□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 XBP1P17861 261 aa13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SNAPC2Q13487 334 aa13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 SYDE2Q5VT97 1194 aa13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 UBA5Q9GZZ9 404 aa13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 V9GY48 417 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 TMEM88BA6NKF7 163 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 hCG_1984214I3L0E3 225 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 CYTH3O43739 400 aa13.85□□□□□ -0.19
LMO3-218ENST00000538020 PPFIA3O75145 1194 aa13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms