RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 RAG1P15918 1043 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 FAAP100Q0VG06 881 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 PLS1Q14651 629 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF792Q3KQV3 632 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 CLEC10AQ8IUN9 316 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SLC44A5Q8NCS7 719 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TINF2Q9BSI4 451 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 VCPKMTQ9H867 229 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TMX2Q9Y320 296 aa16.76■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A27O95847 323 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 COL9A1P20849 921 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF576Q9H609 170 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf115Q9H7X2 142 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TBX21Q9UL17 535 aa16.75■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MYH8P13535 1937 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 PGK2P07205 417 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 CYP2D6P10635 497 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 AKR1A1P14550 325 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 AKR1B1P15121 316 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 RASIP1Q5U651 963 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 RIOX2Q8IUF8 465 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SPICE1Q8N0Z3 855 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 REPS2Q8NFH8 660 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TIFAQ96CG3 184 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MMP19Q99542 508 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SWAP70Q9UH65 585 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 TIMP1P01033 207 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 PDE6AP16499 860 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ACLYP53396 1101 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ICA1Q05084 483 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 C16orf59Q7L2K0 433 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 KLHDC9Q8NEP7 349 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 LCORLQ8N3X6 602 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 PBX4Q9BYU1 374 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SH2D4AQ9H788 454 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 FBXO28Q9NVF7 368 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MOXD2PA6NHM9 499 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 MFSD5Q6N075 450 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-209ENST00000526080 ZNF532Q9HCE3 1301 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 NCOR1O75376 2440 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 MYADML2A6NDP7 307 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM22K7EJ46 135 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 VWA5AO00534 786 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 CST5P28325 142 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 PBX2P40425 430 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 CDK7P50613 346 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 KCTD2Q14681 263 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM240Q5SV17 173 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 AACSQ86V21 672 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa16.7■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 COPB2P35606 906 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 STAT3P40763 770 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 CEP85Q6P2H3 762 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 ASB2Q96Q27 587 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 THEGQ9P2T0 379 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 CNPY2Q9Y2B0 182 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 ELP1O95163 1332 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 GRXCR1A8MXD5 290 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 ADCY6O43306 1168 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 EEF2P13639 858 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 ADGRE1Q14246 886 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 KCNA10Q16322 511 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRU-209ENST00000526080 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms