RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526040.6

RPS6KA1-212, Transcript of ribosomal protein S6 kinase A1, humanhuman

TSL 5

Gene RPS6KA1, Length 500 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1-212ENST00000526040 MKL1Q969V6 931 aa31.7■■■□□ 2.67
RPS6KA1-212ENST00000526040 FBXO28Q9NVF7 368 aa31.7■■■□□ 2.67
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa31.7■■■□□ 2.67
RPS6KA1-212ENST00000526040 RPTORQ8N122 1335 aa31.7■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 BRCA2P51587 3418 aa31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 APBA2Q99767 749 aa31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANAPC4Q9UJX5 808 aa31.69■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLIN4Q96Q06 1357 aa31.68■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 PLS1Q14651 629 aa31.68■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 SHCBP1Q8NEM2 672 aa31.68■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 INCENPQ9NQS7 918 aa31.68■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP31.68■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 TTLL1O95922 423 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 NDUFB10O96000 172 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 FGAP02671 866 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 CAPN2P17655 700 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 ERCC3P19447 782 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 GRB14Q14449 540 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCL14Q16627 93 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCDC171Q6TFL3 1326 aa31.67■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 TFRCP02786 760 aaKnown RBP31.66■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa31.66■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 STRNO43815 780 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 TMEM132BQ14DG7 1078 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 TACC3Q9Y6A5 838 aa31.65■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 HOXC6P09630 235 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 PDE4AP27815 886 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 NCAPG2Q86XI2 1143 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 MROH8Q9H579 483 aa31.64■■■□□ 2.66
RPS6KA1-212ENST00000526040 TSPY2A6NKD2 308 aa31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 VWA5AO00534 786 aa31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLF1Q9BQI6 1058 aa31.63■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZMYM6O95789 1325 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 FGRP09769 529 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 NPLOC4Q8TAT6 608 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa31.62■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 HIP1O00291 1037 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ORC4O43929 436 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC25A27O95847 323 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPP9Q86TI2 863 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 FLRT1Q9NZU1 646 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.61■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ADORA2AP29274 412 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 STAT3P40763 770 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLFN13Q68D06 897 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 RIOX2Q8IUF8 465 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 REPS2Q8NFH8 660 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 IL17RBQ9NRM6 502 aa31.6■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 MFSD14CQ5VZR4 134 aa31.59■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 TOMM22Q9NS69 142 aa31.59■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ABRAQ8N0Z2 381 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 STX8Q9UNK0 236 aa31.58■■■□□ 2.65
RPS6KA1-212ENST00000526040 NMT2O60551 498 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 HAND2P61296 217 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 TTC22Q5TAA0 569 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 FEM1BQ9UK73 627 aa31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 COBLO75128 1261 aa31.56■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 FCER1AP12319 257 aa31.56■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 BMP3P12645 472 aa31.56■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 ANKLE1Q8NAG6 615 aa31.55■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 KIFC2Q96AC6 838 aa31.55■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 HTATIP2Q9BUP3 242 aa31.55■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 SLC5A4Q9NY91 659 aa31.55■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 ZBED4O75132 1171 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 COPB2P35606 906 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 AKNAD1Q5T1N1 836 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 MFSD6Q6ZSS7 791 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 DPF3Q92784 378 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 OGDHLQ9ULD0 1010 aa31.54■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 IGHA2P01877 340 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 CYP2C19P33261 490 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 NOVP48745 357 aa31.53■■■□□ 2.64
RPS6KA1-212ENST00000526040 OLFML2BQ68BL8 750 aa31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms