RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525711.1

UBASH3B-202, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 572 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-202ENST00000525711 SWAP70Q9UH65 585 aa17.18■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 A0A1W2PQY0 241 aa17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 RLBP1P12271 317 aa17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 DNAJB2P25686 324 aa17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 GBF1Q92538 1859 aa17.17■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 DCDC2CA8MYV0 355 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TNFRSF10AO00220 468 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 WDR46O15213 610 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 PGK1P00558 417 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 AKR1A1P14550 325 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 ITGB8P26012 769 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 RRP1P56182 461 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 ICA1Q05084 483 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 KCTD2Q14681 263 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 SPICE1Q8N0Z3 855 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 PANK1Q8TE04 598 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TINF2Q9BSI4 451 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 C1orf115Q9H7X2 142 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 VCPKMTQ9H867 229 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 MYO9BQ13459 2157 aa17.16■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TTC28Q96AY4 2481 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 MCM3APO60318 1980 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 COPB2P35606 906 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 EPHB4P54760 987 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 GRIN2CQ14957 1233 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC174Q6PII3 467 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 ERC1Q8IUD2 1116 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TOX2Q96NM4 488 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 STARD7Q9NQZ5 370 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 CNPY2Q9Y2B0 182 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TMX2Q9Y320 296 aa17.15■□□□□ 0.34
UBASH3B-202ENST00000525711 TMEM132BQ14DG7 1078 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 AACSQ86V21 672 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 RIOX2Q8IUF8 465 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 TIFAQ96CG3 184 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF576Q9H609 170 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 MROH7Q68CQ1 1323 aa17.14■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 MYH4Q9Y623 1939 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 MOXD2PA6NHM9 499 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 PGK2P07205 417 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 PDE6AP16499 860 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 COL9A1P20849 921 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 AMOTL1Q8IY63 956 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 USP38Q8NB14 1042 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SDR42E1Q8WUS8 393 aa17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP17.13■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS4O75173 837 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 TIMP1P01033 207 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ACLYP53396 1101 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 EVX2Q03828 476 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 FAAP100Q0VG06 881 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF792Q3KQV3 632 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 C20orf194Q5TEA3 1177 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ITPRIPQ8IWB1 547 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC17Q96LX7 622 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 GOPCQ9HD26 462 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 DDX19BQ9UMR2 479 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF532Q9HCE3 1301 aa17.12■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 AKR1B1P15121 316 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 STAT3P40763 770 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 LCORLQ8N3X6 602 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa17.11■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CYP2D6P10635 497 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 MFSD5Q6N075 450 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 CEP85Q6P2H3 762 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 DYNLL2Q96FJ2 89 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 GLT1D1Q96MS3 346 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 THEGQ9P2T0 379 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 FAM184BQ9ULE4 1060 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 COG6Q9Y2V7 657 aa17.1■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 VWA5AO00534 786 aa17.09■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 RAD21O60216 631 aa17.09■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa17.09■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 SIAH1Q8IUQ4 282 aa17.09■□□□□ 0.33
UBASH3B-202ENST00000525711 IL27Q8NEV9 243 aa17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms