RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 F6X3S4 739 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 PAGE1O75459 146 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 LEFTY1O75610 366 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 RACK1P63244 317 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 STK35Q8TDR2 534 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM39AQ9NV64 488 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 U3KQE9 123 aa6.09□□□□□ -1.43
HDAC2-216ENST00000523628 SETD5Q9C0A6 1442 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 CLTCL1P53675 1640 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 CEACAM5P06731 702 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 CELA3AP09093 270 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 OXCT1P55809 520 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF394Q53GI3 561 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PDZD3Q86UT5 571 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 KCNB2Q92953 911 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SLC26A8Q96RN1 970 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 AKAP2Q9Y2D5 859 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PPLO60437 1756 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.08□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ENC1O14682 589 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NEFMP07197 916 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 GSTT1P30711 240 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 CD96P40200 585 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 AOC3Q16853 763 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 FAM168AQ92567 244 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MYOM2P54296 1465 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 KIF1AQ12756 1690 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TECPR2O15040 1411 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.07□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM265A0A087WTH1 108 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF76P36508 570 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SULF2Q8IWU5 870 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ISL2Q96A47 359 aa6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ARNTP27540 789 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ERVK-24P63145 666 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TOP6BLQ8N6T0 577 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 RNF214Q8ND24 703 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 RNF34Q969K3 372 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 IFT172Q9UG01 1749 aa6.05□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 DBX1A6NMT0 343 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 BMP6P22004 513 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 GARTP22102 1010 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 NME2P22392 152 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 TNNI2P48788 182 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF124Q15973 351 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.04□□□□□ -1.44
HDAC2-216ENST00000523628 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.04□□□□□ -1.44
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