RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520960.2

CYFIP2-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 2, human

TSL 2

Gene CYFIP2, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYFIP2-208	ENST00000520960	PRDM1	O75626	825 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ERCC3	P19447	782 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	RASA1	P20936	1047 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CHRDL2	Q6WN34	429 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TICAM2	Q86XR7	235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	MROH8	Q9H579	483 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		11.18	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	STRN	O43815	780 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SLC25A27	O95847	323 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ADORA2A	P29274	412 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SLC4A3	P48751	1232 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	PPARA	Q07869	468 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	GRB14	Q14449	540 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	USP6NL	Q92738	828 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SGSM2	O43147	1006 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	FCER1A	P12319	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CYP2C19	P33261	490 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	COPB2	P35606	906 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	KCTD2	Q14681	263 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	MMP19	Q99542	508 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	NYAP2	Q9P242	653 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		11.16	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960		F5H6K3	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	MSC	O60682	206 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	ZBED4	O75132	1171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TTLL1	O95922	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	NDUFB10	O96000	172 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	HOXC6	P09630	235 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	STAT3	P40763	770 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	KLRC3	Q07444	240 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	USP26	Q9BXU7	913 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	IL25	Q9H293	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CYFIP2-208	ENST00000520960	PTPRF	P10586	1907 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	VWA5A	O00534	786 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	TFAP4	Q01664	338 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	STX8	Q9UNK0	236 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	HTT	P42858	3142 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	MYH1	P12882	1939 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	SLFN13	Q68D06	897 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CYFIP2-208	ENST00000520960	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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