RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ANO2Q9NQ90 1003 aa13.45□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.45□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PFASO15067 1338 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PLXNB2O15031 1838 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PRKAB2O43741 272 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CNGA1P29973 690 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ATP2B2Q01814 1243 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 COG2Q14746 738 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 LHX8Q68G74 356 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM179Q6ZVK1 233 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DDRGK1Q96HY6 314 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 LRCH3Q96II8 777 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 GDF15Q99988 308 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 NACAP1Q9BZK3 213 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC10Q9NYD6 342 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 FLRT1Q9NZU1 646 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SWAP70Q9UH65 585 aa13.44□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 APPP05067 770 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2C19P33261 490 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 NPLOC4Q8TAT6 608 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DSCC1Q9BVC3 393 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa13.43□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 HOXC6P09630 235 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 COL6A1P12109 1028 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 AKR1B1P15121 316 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 BMP8BP34820 402 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ICA1Q05084 483 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 GRB14Q14449 540 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PLS1Q14651 629 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DPP9Q86TI2 863 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 AMOTL1Q8IY63 956 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPICE1Q8N0Z3 855 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 IL25Q9H293 177 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CTNNA3Q9UI47 895 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MYH1P12882 1939 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DOCK3Q8IZD9 2030 aa13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP13.42□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L12C9JPN9 530 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L21D6R901 530 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM22K7EJ46 135 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 FLOT1O75955 427 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MCCP23508 829 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ADORA2AP29274 412 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ALX1Q15699 326 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 LRRC26Q2I0M4 334 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MAP4K1Q92918 833 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 USP26Q9BXU7 913 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SPATC1LQ9H0A9 340 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SH2D4AQ9H788 454 aa13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 MSCO60682 206 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SEC24BO95487 1268 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ERCC3P19447 782 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CDK8P49336 464 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 PTH1RQ03431 593 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 C12orf60Q5U649 245 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 NCAPG2Q86XI2 1143 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 IFNL3Q8IZI9 196 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 LPAR1Q92633 364 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 ATG4CQ96DT6 458 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC17Q96LX7 622 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 NAPBQ9H115 298 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 TMX2Q9Y320 296 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 NAV1Q8NEY1 1877 aa13.4□□□□□ -0.26
UBE2B-208ENST00000511807 STRNO43815 780 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 RAD21O60216 631 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 TDO2P48775 406 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 VPS53Q5VIR6 699 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 RNF20Q5VTR2 975 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 MB21D1Q8N884 522 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 SHCBP1Q8NEM2 672 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 TRPV1Q8NER1 839 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 VCPKMTQ9H867 229 aa13.39□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 WDR46O15213 610 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 FGAP02671 866 aa13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 CYBAP13498 195 aa13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 ANO1Q5XXA6 986 aa13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 OLFML2BQ68BL8 750 aa13.38□□□□□ -0.27
UBE2B-208ENST00000511807 C16orf86Q6ZW13 317 aa13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms