RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, human

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOPBP1-208	ENST00000511439	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF34	Q969K3	372 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDH24	Q86UP0	819 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM87B	Q96K49	555 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	GGT7	Q9UJ14	662 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ALK	Q9UM73	1620 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	NFIB	O00712	420 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCF3	P15923	654 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDK8	P49336	464 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TNK2	Q07912	1038 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PWP1	Q13610	501 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RELL1	Q8IUW5	271 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	MCAT	Q8IVS2	390 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABHD4	Q8TB40	342 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	COPRS	Q9NQ92	184 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PLA2R1	Q13018	1463 aa		5.75	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RICTOR	Q6R327	1708 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TTC6	Q86TZ1	520 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RHOV	Q96L33	236 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM74	Q96NL1	305 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439		F6X3S4	739 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	BPNT1	O95861	308 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	MYLIP	Q8WY64	445 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		5.73	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PF4	P02776	101 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ESR1	P03372	595 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	TMEM253	P0C7T8	217 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	YY1	P25490	414 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	LMNB2	Q03252	620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ZNF394	Q53GI3	561 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	USP48	Q86UV5	1035 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CYB5D2	Q8WUJ1	264 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	ACSF2	Q96CM8	615 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DIRC2	Q96SL1	478 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	IQGAP2	Q13576	1575 aa		5.72	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		5.71	□□□□□ -1.49
TOPBP1-208	ENST00000511439	LRP5	O75197	1615 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	DISP1	Q96F81	1524 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	HPX	P02790	462 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	GART	P22102	1010 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	CFP	P27918	469 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
TOPBP1-208	ENST00000511439	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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