RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	GAB4	Q2WGN9	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	MCTP1	Q6DN14	999 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	HDAC8	Q9BY41	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	WASH4P	A8MWX3	477 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DNAJA1	P31689	397 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PCBP3	P57721	371 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC7A5	Q01650	507 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TNNI3K	Q59H18	835 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047		A0A1W2PQH9	124 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047		C9IYK1	514 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TP53	P04637	393 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	RAC2	P15153	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	GDNF	P39905	211 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	AFM	P43652	599 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CASP7	P55210	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DUSP4	Q13115	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ASIC4	Q96FT7	647 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	MEIS1	O00470	390 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PAX4	O43316	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ITGA4	P13612	1032 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CD247	P20963	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	OXR1	Q8N573	874 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM86C1	Q9NVL1	165 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	TCFL5	Q9UL49	500 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATXN3-208	ENST00000504047	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	GSN	P06396	782 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	FGR	P09769	529 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	NAT2	P11245	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	ITGB5	P18084	799 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	HK2	P52789	917 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	DCAF15	Q66K64	600 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	VHLL	Q6RSH7	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	PDZD8	Q8NEN9	1154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	GML	Q99445	158 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	HAUS7	Q99871	368 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047		A0A087WZG4	1122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	SHOX	O15266	292 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	PAPLN	O95428	1278 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	SYP	P08247	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	BMP8B	P34820	402 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	TEK	Q02763	1124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	CHRNE	Q04844	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	NCAPH	Q15003	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	KIAA1211L	Q6NV74	962 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATXN3-208	ENST00000504047	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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