RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503062.1

ADD1-208, Transcript of adducin 1, human

TSL 2

Gene ADD1, Length 488 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ADD1-208	ENST00000503062	CA3	P07451	260 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CDK7	P50613	346 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	PLS1	Q14651	629 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	MROH8	Q9H579	483 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	PALD1	Q9ULE6	856 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FLT1	P17948	1338 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CIAO1	O76071	339 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FCER1A	P12319	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ACER1	Q8TDN7	264 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	TINF2	Q9BSI4	451 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	MYADML2	A6NDP7	307 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ARVCF	O00192	962 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	HLA-DOA	P06340	250 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	COG2	Q14746	738 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	HIPK3	Q9H422	1215 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ADD1-208	ENST00000503062	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		13.71	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	DCX	O43602	365 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	TANGO6	Q9C0B7	1094 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	BAG3	O95817	575 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	PGK2	P07205	417 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ASGR1	P07306	291 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	PLCG2	P16885	1265 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	CCL23	P55773	120 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	TIMM10	P62072	90 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	GRB10	Q13322	594 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	MMP19	Q99542	508 aa		13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	CD4	P01730	458 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	USP44	Q9H0E7	712 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		13.68	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	TRIO	O75962	3097 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	IL9	P15248	144 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	TAP1	Q03518	808 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	XAGE2	Q96GT9	111 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062		A0A1B0GUL7	405 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ARHGEF15	O94989	841 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	KCNA5	P22460	613 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	KCTD2	Q14681	263 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	MYH1	P12882	1939 aa		13.66	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	ZNF536	O15090	1300 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	GFRA3	O60609	400 aa		13.65	□□□□□ -0.22
ADD1-208	ENST00000503062	LPXN	O60711	386 aa		13.65	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms