RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494468.1

XPO1-223, Transcript of exportin 1, human

TSL 3

Gene XPO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XPO1-223	ENST00000494468	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	HAUS7	Q99871	368 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	TRIT1	Q9H3H1	467 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468		B2RBV5	119 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	GJB6	O95452	261 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	CD97	P48960	835 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	TCEAL1	Q15170	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	GBP3	Q9H0R5	595 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		4.97	□□□□□ -1.61
XPO1-223	ENST00000494468		H3BS24	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	RBAK-RBAKDN	I3L0D1	243 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	MED26	O95402	600 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	EPHX1	P07099	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ITGA4	P13612	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PRKCQ	Q04759	706 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	AOC3	Q16853	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ASB11	Q8WXH4	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	UBE2F	Q969M7	185 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	GP6	Q9HCN6	339 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	WHRN	Q9P202	907 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	VAV3	Q9UKW4	847 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		4.96	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SHOX	O15266	292 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SIGLEC6	O43699	453 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PPM1B	O75688	479 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PRAMEF1	O95521	474 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	PRNP	P04156	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	CD247	P20963	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SERINC3	Q13530	473 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ADAT2	Q7Z6V5	191 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	TSPYL5	Q86VY4	417 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	DTX1	Q86Y01	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	CHST7	Q9NS84	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		4.95	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SHISA3	A0PJX4	238 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SUSD5	O60279	629 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	WNT11	O96014	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SRF	P11831	508 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SPINK2	P20155	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ZNF445	P59923	1031 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	IKZF1	Q13422	519 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	FGD4	Q96M96	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	APBA2	Q99767	749 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	EPN3	Q9H201	632 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	RNF114	Q9Y508	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		4.94	□□□□□ -1.62
XPO1-223	ENST00000494468		A0A087WZG4	1122 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms