RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	TSPY8	P0CW00	308 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CYP2B6	P20813	491 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	GRB14	Q14449	540 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CEP95	Q96GE4	821 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607		F5H6K3	240 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	KLRC3	Q07444	240 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ATG4C	Q96DT6	458 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	MROH8	Q9H579	483 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ORC4	O43929	436 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	FGA	P02671	866 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		27.68	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	TFAP4	Q01664	338 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC25A27	O95847	323 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	NDUFB10	O96000	172 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	NOV	P48745	357 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	LAMA4	Q16363	1823 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	COPB2	P35606	906 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	NT5C2	P49902	561 aa		27.65	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	VWA5A	O00534	786 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	ERCC3	P19447	782 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	DEFB118	Q96PH6	123 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		27.64	■■■□□ 2.02
SERBP1-208	ENST00000493607	TSPY2	A6NKD2	308 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	IGHA2	P01877	340 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PDE4A	P27815	886 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	WDR78	Q5VTH9	848 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	REPS2	Q8NFH8	660 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	27.63	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TRIM32	Q13049	653 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP2A1	O14983	1001 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	RAD21	O60216	631 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	FDX1	P10109	184 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TTC22	Q5TAA0	569 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	GMCL1	Q96IK5	515 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	FEM1B	Q9UK73	627 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		27.61	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PLS1	Q14651	629 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	CCL14	Q16627	93 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	PLA2G6	O60733	806 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	ADORA2A	P29274	412 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	STAT3	P40763	770 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	SLFN13	Q68D06	897 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	FCER1A	P12319	257 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	BMP3	P12645	472 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	DPP9	Q86TI2	863 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	INCENP	Q9NQS7	918 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SERBP1-208	ENST00000493607	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		27.57	■■■□□ 2
SERBP1-208	ENST00000493607	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		27.57	■■■□□ 2
SERBP1-208	ENST00000493607	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
SERBP1-208	ENST00000493607	OAZ1	P54368	228 aa		27.57	■■■□□ 2
SERBP1-208	ENST00000493607	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		27.57	■■■□□ 2

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