RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492185.5

NELFE-211, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,786 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-211ENST00000492185 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 FERMT2Q96AC1 680 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 CCDC17Q96LX7 622 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 CLCN1P35523 988 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 DNAJC18Q9H819 358 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 COL4A5P29400 1685 aa22.86■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 TTLL1O95922 423 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.85■■□□□ 1.25
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NELFE-211ENST00000492185 VPS33BQ9H267 617 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 USP17L5A8MUK1 530 aa22.84■■□□□ 1.25
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NELFE-211ENST00000492185 DPEP1P16444 411 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 NLRP12P59046 1061 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 LONRF3Q496Y0 759 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ATP2B1P20020 1258 aa22.84■■□□□ 1.25
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NELFE-211ENST00000492185 SARM1Q6SZW1 724 aa22.84■■□□□ 1.25
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NELFE-211ENST00000492185 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 GMLQ99445 158 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 CSRNP2Q9H175 543 aa22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
NELFE-211ENST00000492185 ENTPD3O75355 529 aa22.83■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.83■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa22.83■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 A0A087WWV3 80 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ESYT2A0FGR8 921 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CACNB3P54284 484 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZNF174Q15697 407 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 DPCR1Q3MIW9 517 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 SPECC1Q5M775 1068 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CPVLQ9H3G5 476 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.81■■□□□ 1.24
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NELFE-211ENST00000492185 PTGDRQ13258 359 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CFAP100Q494V2 611 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 MTMR7Q9Y216 660 aa22.81■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZNF543Q08ER8 600 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 USP49Q70CQ1 688 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CNNM3Q8NE01 707 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 MKL1Q969V6 931 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.8■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZNF75DP51815 510 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.79■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 TCP10Q12799 353 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PNOCQ13519 176 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 SOGA3Q5TF21 947 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 PIGSQ96S52 555 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 NYAP2Q9P242 653 aa22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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NELFE-211ENST00000492185 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.78■■□□□ 1.24
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NELFE-211ENST00000492185 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 SLURP2P0DP57 97 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 CDC25BP30305 580 aa22.77■■□□□ 1.24
NELFE-211ENST00000492185 NAPAP54920 295 aa22.77■■□□□ 1.24
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