RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 SLC10A6Q3KNW5 377 aa7.41□□□□□ -1.22
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CCL20-204ENST00000489160 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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CCL20-204ENST00000489160 SSTR4P31391 388 aa7.38□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 SIGLEC6O43699 453 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 ZNF445P59923 1031 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.37□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 CEACAM5P06731 702 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ITIH2P19823 946 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 MSMPQ1L6U9 139 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 DTX1Q86Y01 620 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 JMYQ8N9B5 988 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 BVESQ8NE79 360 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 SPATA9Q9BWV2 254 aa7.36□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 GPATCH2Q9NW75 528 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 U3KQE9 123 aa7.36□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 MED26O95402 600 aa7.35□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 SPINK2P20155 84 aa7.35□□□□□ -1.23
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CCL20-204ENST00000489160 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 C2orf27AQ580R0 203 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 SDE2Q6IQ49 451 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 POMZP3Q6PJE2 187 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 FIBCD1Q8N539 461 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 LRRN4CLQ8ND94 238 aa7.35□□□□□ -1.23
CCL20-204ENST00000489160 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.35□□□□□ -1.23
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