RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486042.1

PHC3-211, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

TSL 3

Gene PHC3, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-211ENST00000486042 RTP5Q14D33 572 aa6.21□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SLC14A2Q15849 920 aa6.21□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 PWWP2AQ96N64 755 aa6.21□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 EFEMP2O95967 443 aa6.2□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 RNF111Q6ZNA4 994 aa6.2□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 CRELD1Q96HD1 420 aa6.2□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 LRRN2O75325 713 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ERVFRD-1P60508 538 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 LDHDQ86WU2 507 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 IGDCC3Q8IVU1 814 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 C12orf49Q9H741 205 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SPG7Q9UQ90 795 aa6.19□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 K7ESM1 405 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 USP17L7P0C7H9 530 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 KCNC1P48547 511 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 TMEM62Q0P6H9 643 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SEPT6Q14141 434 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ZNF827Q17R98 1081 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 CCDC27Q2M243 656 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 MAP6Q96JE9 813 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ASPNQ9BXN1 380 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.18□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SHISA3A0PJX4 238 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 MPOP05164 745 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ZXDAP98168 799 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 CEP128Q6ZU80 1094 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 RGS22Q8NE09 1264 aa6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 TNFRSF1AP19438 455 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 WAPLQ7Z5K2 1190 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 FAM13CQ8NE31 585 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa6.16□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SDHBP21912 280 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 MAPK1P28482 360 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SLURP1P55000 103 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 UBXN11Q5T124 520 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 VWCEQ96DN2 955 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
PHC3-211ENST00000486042 FFAR3O14843 346 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 ARL4AP40617 200 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 MAPK8P45983 427 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 TMEM201Q5SNT2 666 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 SRRDQ9UH36 339 aa6.14□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 PLCG1P19174 1290 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 TNNI2P48788 182 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 RTP1P59025 263 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 LAPTM5Q13571 262 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 TMC6Q7Z403 805 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 FRMD6Q96NE9 622 aa6.13□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 ATP2B2Q01814 1243 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 LINC00116Q8NCU8 138 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 HDAC8Q9BY41 377 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.12□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 TMEM82A0PJX8 343 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 LIG3P49916 1009 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 ADAM17P78536 824 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PHC3-211ENST00000486042 SETDB2Q96T68 719 aa6.11□□□□□ -1.43
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