RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 LY9Q9HBG7 655 aa18.23■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ERICH2A1L162 156 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 GSG1L2A8MUP6 293 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 BMP6P22004 513 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 NR5A1Q13285 461 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 EEF2KMTQ96G04 330 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 KRT9P35527 623 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PPP2R5AQ15172 486 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 NACAP1Q9BZK3 213 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TUBE1Q9UJT0 475 aa18.22■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 CDKL5O76039 1030 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 WTAPQ15007 396 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 NUP188Q5SRE5 1749 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 CDR1P51861 262 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 EVX2Q03828 476 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 GRIN1Q05586 938 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC122Q5T0U0 273 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 UBAC1Q9BSL1 405 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 MACROD2A1Z1Q3 448 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 IRAK1P51617 712 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 PDCLQ13371 301 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 ERFEQ4G0M1 354 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 TAB2Q9NYJ8 693 aa18.21■□□□□ 0.51
CCSAP-204ENST00000483092 MSANTD4Q8NCY6 345 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RAB21Q9UL25 225 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PTF1AQ7RTS3 328 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CD248Q9HCU0 757 aa18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PDE6BP35913 854 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RTN1Q16799 776 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MLKLQ8NB16 471 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FGFR2P21802 821 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NF2P35240 595 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SCLT1Q96NL6 688 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MMS19Q96T76 1030 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SLC24A3Q9HC58 644 aa18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SYF2O95926 243 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF8Q8NHQ8 419 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CAMTA2O94983 1202 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 KLRK1P26718 216 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 USP5P45974 858 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SLC7A5Q01650 507 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 USP49Q70CQ1 688 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SLC51AQ86UW1 340 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CNGA4Q8IV77 575 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM22Q8IYM9 498 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 OXER1Q8TDS5 423 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TMEM87BQ96K49 555 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SCP2P22307 547 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 RPAINQ86UA6 219 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SELENOOQ9BVL4 669 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.18■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 FAM205CA6NFA0 338 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF185O15231 689 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NEBLO76041 1014 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 PSEN1P49768 467 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 C2orf54Q08AI8 447 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CEP89Q96ST8 783 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 KIRREL3Q8IZU9 778 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CHP1Q99653 195 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CABP5Q9NP86 173 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 VPS54Q9P1Q0 977 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 CTNND2Q9UQB3 1225 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 NWD2Q9ULI1 1742 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 COG1Q8WTW3 980 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa18.17■□□□□ 0.5
CCSAP-204ENST00000483092 MFAP3LO75121 409 aa18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms