RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479994.1

HCLS1-206, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 450 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-206	ENST00000479994	DDAH1	O94760	285 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	GJA8	P48165	433 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	ICA1	Q05084	483 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	PRKG1	Q13976	671 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	MKL1	Q969V6	931 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	PIEZO1	Q92508	2521 aa		13.47	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	GH2	P01242	217 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	AKR1B1	P15121	316 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	KIF5B	P33176	963 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	USP14	P54578	494 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	ANTXR2	P58335	489 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	SEC23A	Q15436	765 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	LY9	Q9HBG7	655 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	GOPC	Q9HD26	462 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	PTPRF	P10586	1907 aa		13.46	□□□□□ -0.25
HCLS1-206	ENST00000479994	NID2	Q14112	1375 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZBTB43	O43298	467 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CDKL5	O76039	1030 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GNAQ	P50148	359 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	AK2	P54819	239 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	BRF1	Q92994	677 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CEP95	Q96GE4	821 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	PTPN18	Q99952	460 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	FAM196B	A6NMK8	535 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GDF11	O95390	407 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GJB1	P08034	283 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	PPAT	Q06203	517 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ERO1B	Q86YB8	467 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	TDH	Q8IZJ6	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	LPAR1	Q92633	364 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	KIF3A	Q9Y496	699 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.44	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	EVX2	Q03828	476 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SEPT2	Q15019	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	APOA5	Q6Q788	366 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	FAM161B	Q96MY7	647 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	TMX2	Q9Y320	296 aa		13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SMIM22	K7EJ46	135 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	CPA1	P15085	419 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	PTPRA	P18433	802 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	SMARCA1	P28370	1054 aa		13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
HCLS1-206	ENST00000479994	VGLL4	Q14135	290 aa		13.42	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.3 ms