RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475693.1

ATG4B-217, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 2,237 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-217ENST00000475693 KIF5BP33176 963 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 SNAP25P60880 206 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF15Q66K64 600 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 MCTP1Q6DN14 999 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 HOMER1Q86YM7 354 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 C8orf76Q96K31 380 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 ASNSP08243 561 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 SNHG28P0DPA3 235 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.953e-7■□□□□ 9.2
ATG4B-217ENST00000475693 VPS54Q9P1Q0 977 aa20.96■□□□□ 0.95
ATG4B-217ENST00000475693 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF8L1A6NGE4 600 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ADAMTS3O15072 1205 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF112Q9UJU3 913 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SCN4AP35499 1836 aa20.95■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 F13A1P00488 732 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SLC1A4P43007 532 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ZNF543Q08ER8 600 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 WDR90Q96KV7 1748 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PDCP20941 246 aa20.94■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PPP2R5BQ15173 497 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 KRT40Q6A162 431 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PIGSQ96S52 555 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 MAP3K14Q99558 947 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 GDPD2Q9HCC8 539 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TMX2Q9Y320 296 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 KIF28PB7ZC32 967 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa20.93■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TRIM75PA6NK02 468 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 DEXIO95424 95 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PTPRAP18433 802 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SPP2Q13103 211 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SCYL3Q8IZE3 742 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 USP17L10C9JJH3 530 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 VGLL4Q14135 290 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 FEZ1Q99689 392 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 STK36Q9NRP7 1315 aa20.92■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 DDX11L8A8MPP1 907 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TMEM232C9JQI7 657 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 MTMR2Q13614 643 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.91■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 OXER1Q8TDS5 423 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 RESTQ13127 1097 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PICK1Q9NRD5 415 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 MYH6P13533 1939 aa20.9■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 GNAQP50148 359 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 KIF3AQ9Y496 699 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.89■□□□□ 0.94
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 BMP3P12645 472 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 SCG2P13521 617 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 WWC2Q6AWC2 1192 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 HOOK2Q96ED9 719 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 VCPKMTQ9H867 229 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 ELP3Q9H9T3 547 aa20.89■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 BTBD18B2RXH4 712 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 MAP3K9P80192 1104 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 NR5A1Q13285 461 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 DCAF4Q8WV16 495 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 COA7Q96BR5 231 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 RIOX1Q9H6W3 641 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 CNPY2Q9Y2B0 182 aa20.88■□□□□ 0.93
ATG4B-217ENST00000475693 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112 ms