RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471364.1

RUBCN-208, Transcript of RUN and cysteine rich domain containing beclin 1 interacting protein, humanhuman

TSL 3

Gene RUBCN, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCN-208ENST00000471364 LHX8Q68G74 356 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 RUFY3Q7L099 469 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.95□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L15C9J2P7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L13C9JLJ4 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L11C9JVI0 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L18D6R9N7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L22D6RA61 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L19D6RCP7 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L20D6RJB6 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP17L24Q0WX57 530 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MAP2K5Q13163 448 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LRRC26Q2I0M4 334 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CERS3Q8IU89 383 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 FEZ1Q99689 392 aa14.94□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 GH2P01242 217 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CYP21A2P08686 494 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP14P54578 494 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 KRT32Q14532 448 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 UBE3CQ15386 1083 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 C12orf42Q96LP6 360 aa14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MYH8P13535 1937 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 PDE6AP16499 860 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CYP7A1P22680 504 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 RPS6KB1P23443 525 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 USP5P45974 858 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 WDR78Q5VTH9 848 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 TATDN1Q6P1N9 297 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.92□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 A0A0C4DFX4 3053 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 FOXP2O15409 715 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 GPAA1O43292 621 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 MSCO60682 206 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ATP2B2Q01814 1243 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 EHD4Q9H223 541 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 RLFQ13129 1914 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 NAV1Q8NEY1 1877 aa14.91□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CNMDO75829 334 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LARGE1O95461 756 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 PTPREP23469 700 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CNGA1P29973 690 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LBX2Q6XYB7 198 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 TTC6Q86TZ1 520 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 NEK1Q96PY6 1258 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 CABP5Q9NP86 173 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
RUBCN-208ENST00000471364 LTBP2Q14767 1821 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 HOXC6P09630 235 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 VCAM1P19320 739 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 NUCB2P80303 420 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 MAP3K12Q12852 859 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 MAGEB6Q8N7X4 407 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 LPAR1Q92633 364 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.89□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 DNM1LO00429 736 aa14.88□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 MCM4P33991 863 aa14.88□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 GRB14Q14449 540 aa14.88□□□□□ -0.03
RUBCN-208ENST00000471364 BTBD7Q9P203 1132 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms