RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 RAD21O60216 631 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PTPREP23469 700 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP2K5Q13163 448 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 GRB14Q14449 540 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 WDR78Q5VTH9 848 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MKL1Q969V6 931 aa22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 HIP1O00291 1037 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 NDUFB10O96000 172 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPTORQ8N122 1335 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 F5H6K3 240 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 SGPL1O95470 568 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TFAP4Q01664 338 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 KLRC3Q07444 240 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 DEFB118Q96PH6 123 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 ORC4O43929 436 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGAP02671 866 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 HOXC6P09630 235 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FGRP09769 529 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PDE4AP27815 886 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TRIM32Q13049 653 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 MROH8Q9H579 483 aa22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TSPY2A6NKD2 308 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 VWA5AO00534 786 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 STRNO43815 780 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 ERCC3P19447 782 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLS1Q14651 629 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TMEM132BQ14DG7 1078 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLC25A27O95847 323 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 CCL14Q16627 93 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TTC22Q5TAA0 569 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCP11498 1178 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 COPB2P35606 906 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 RIOX2Q8IUF8 465 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 REPS2Q8NFH8 660 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC10-208ENST00000469521 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 ADORA2AP29274 412 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 INCENPQ9NQS7 918 aa22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 NOVP48745 357 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 SLFN13Q68D06 897 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 GMCL1Q96IK5 515 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 FEM1BQ9UK73 627 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 STX8Q9UNK0 236 aa22.31■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 STAT3P40763 770 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 NBPF3Q9H094 633 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.3■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 ATP2A1O14983 1001 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 NMT2O60551 498 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 IGHA2P01877 340 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 FCER1AP12319 257 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 BMP3P12645 472 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 HAND2P61296 217 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 DPP9Q86TI2 863 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC10-208ENST00000469521 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
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