RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453727.6

LMO3-210, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 5

Gene LMO3, Length 2,403 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-210ENST00000453727 TROAPQ12815 778 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 IFFO2Q5TF58 517 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 EP400NLQ6ZTU2 488 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CATIPQ7Z7H3 387 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DEF6Q9H4E7 631 aa9.77□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CDKL5O76039 1030 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 HLA-DOAP06340 250 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SLURP2P0DP57 97 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TPM4P67936 248 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ZNF592Q92610 1267 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 VEZTQ9HBM0 779 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SERPINB13Q9UIV8 391 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 UBE2Q2LH0YL09 131 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ENTPD3O75355 529 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GYS2P54840 703 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GUCY1B3Q02153 619 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DGKHQ86XP1 1220 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 NEDD1Q8NHV4 660 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa9.76□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TRIM66O15016 1216 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GRIN3BO60391 1043 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 IFNAR1P17181 557 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FAM173BQ6P4H8 233 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CCDC82Q8N4S0 544 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ANKS1AQ92625 1134 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 AIFM3Q96NN9 605 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GDPD2Q9HCC8 539 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 PI4KBQ9UBF8 816 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CNPY2Q9Y2B0 182 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 MYH6P13533 1939 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 H7C1D1 291 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DDAH1O94760 285 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DDNO94850 711 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CALM1P0DP23 149 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CALM2P0DP24 149 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CALM3P0DP25 149 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SHMT1P34896 483 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 RESTQ13127 1097 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 NBPF11Q86T75 865 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 HOMEZQ8IX15 550 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 NEK11Q8NG66 645 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 C8orf76Q96K31 380 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DRC1Q96MC2 740 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 KAT14Q9H8E8 782 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GPRC5DQ9NZD1 345 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 STX8Q9UNK0 236 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.75□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 STK36Q9NRP7 1315 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 AKR1B1P15121 316 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 PPP2R5BQ15173 497 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CCDC178Q5BJE1 867 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CEP135Q66GS9 1140 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CEP120Q8N960 986 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 PNMA1Q8ND90 353 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ERO1AQ96HE7 468 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CSRNP1Q96S65 589 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 EHD4Q9H223 541 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 DNAJC18Q9H819 358 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 SWAP70Q9UH65 585 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ATRNL1Q5VV63 1379 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FAM196BA6NMK8 535 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 PLEKHA8P1O95397 391 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 GUCY1A2P33402 732 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ZSCAN26Q16670 478 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FKBP1CQ5VVH2 108 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 CEP95Q96GE4 821 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 TMEM47Q9BQJ4 181 aa9.74□□□□□ -0.85
LMO3-210ENST00000453727 ALG1Q9BT22 464 aa9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms