RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428783.1

EEF1DP3-201, Transcript of eukaryotic translation elongation factor 1 delta pseudogene 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene EEF1DP3, Length 1,309 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3-201ENST00000428783 FBXL16Q8N461 479 aa24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.08■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.07■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ANTXR2P58335 489 aa24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SP3Q02447 781 aa24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 RABEP1Q15276 862 aa24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ANKRD1Q15327 319 aa24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CCDC69A6NI79 296 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SEC23AQ15436 765 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 C17orf99Q6UX52 265 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CHST3Q7LGC8 479 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.05■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 F5H6K3 240 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 NDUFB10O96000 172 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 HERVK_113P62684 666 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 KLRC3Q07444 240 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CD99L2Q8TCZ2 262 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 MTMR7Q9Y216 660 aa24.04■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 PNMA1Q8ND90 353 aa24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ERO1AQ96HE7 468 aa24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 LY9Q9HBG7 655 aa24.03■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CALM1P0DP23 149 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CALM2P0DP24 149 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 CALM3P0DP25 149 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 BCRP11274 1271 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 SLFN13Q68D06 897 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 Q6ZUG5 572 aa24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
EEF1DP3-201ENST00000428783 ST18O60284 1047 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 FLOT1O75955 427 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 NEK4P51957 841 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 DCAF4Q8WV16 495 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.01■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 PARP14Q460N5 1801 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 DDAH1O94760 285 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 RCAN1P53805 252 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 KIF22Q14807 665 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 GMCL1Q96IK5 515 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 MAP3K14Q99558 947 aa24■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 RLFQ13129 1914 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 PEX10O60683 326 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 SLC1A4P43007 532 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 COG2Q14746 738 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 KIF2CQ99661 725 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.99■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 MGAMO43451 1857 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 CPA1P15085 419 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 KIF5BP33176 963 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 PPP2R5BQ15173 497 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.98■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 BMP3P12645 472 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 BRF1Q92994 677 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 TRIM17Q9Y577 477 aa23.97■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 DSG3P32926 999 aa23.96■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 MCM2P49736 904 aa23.96■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 CAP1Q01518 475 aa23.96■■□□□ 1.43
EEF1DP3-201ENST00000428783 CCDC96Q2M329 555 aa23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms