RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 GJB6O95452 261 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 DDR2Q16832 855 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 HAUS7Q99871 368 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.56□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SHOXO15266 292 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 EPHX1P07099 455 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CD97P48960 835 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CLCN7P51798 805 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 NCAPHQ15003 741 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 AOC3Q16853 763 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 UBE2FQ969M7 185 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 MEIS1O00470 390 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CBFA2T2O43439 604 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 IGSF3O75054 1194 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CD247P20963 164 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CD96P40200 585 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 BNIP3Q12983 259 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SOGA3Q5TF21 947 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 NBPF4Q96M43 638 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 FGD4Q96M96 766 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 GP6Q9HCN6 339 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 MINPP1Q9UNW1 487 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SNX11Q9Y5W9 270 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 PRAMEF1O95521 474 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SRFP11831 508 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 TCEAL1Q15170 157 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 BRF1Q92994 677 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 LNPKQ9C0E8 428 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-211ENST00000426951 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SPINK2P20155 84 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PRKCQQ04759 706 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SERINC3Q13530 473 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DTX1Q86Y01 620 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ASB11Q8WXH4 323 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 GBP3Q9H0R5 595 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CHST7Q9NS84 486 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CCDC39Q9UFE4 941 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SUSD2Q9UGT4 822 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 VAV3Q9UKW4 847 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SIGLEC6O43699 453 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SUSD5O60279 629 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ITGA4P13612 1032 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZNF445P59923 1031 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 DPH6Q7L8W6 267 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 MISP3Q96FF7 219 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 HDAC8Q9BY41 377 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 OSBPL2Q9H1P3 480 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 WHRNQ9P202 907 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SLC5A6Q9Y289 635 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PPM1BO75688 479 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 CD8BP10966 210 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 LRP8Q14114 963 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 PPP2R5DQ14738 602 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SV2CQ496J9 727 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 SPRED2Q7Z698 418 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-211ENST00000426951 STK11IPQ8N1F8 1099 aa6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms