RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 PEAK1Q9H792 1746 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 DTNBO60941 627 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ETF1P62495 437 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SARNPP82979 210 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP12.16□□□□□ -0.462e-6■■■■■ 28
EFTUD2-202ENST00000426333 CDC37L1Q7L3B6 337 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RRAGAQ7L523 313 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GPIHBP1Q8IV16 184 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MAIP1Q8WWC4 291 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TM6SF1Q9BZW5 370 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BCL2L12Q9HB09 334 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHDC4Q8TBB5 520 aa12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BRD1O95696 1058 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 HOXB7P09629 217 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 STX2P32856 288 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NCAPH2Q6IBW4 605 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CASC4Q6P4E1 433 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NELFCDQ8IXH7 590 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 NELFBQ8WX92 580 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 XAGE2Q96GT9 111 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MYL10Q9BUA6 226 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GINS2Q9Y248 185 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 STK24Q9Y6E0 443 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 JAK2O60674 1132 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 GCP02774 474 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ITGA6P23229 1130 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP7Q14244 749 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 C2CD5Q86YS7 1000 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PLBD2Q8NHP8 589 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 ATP2A3Q93084 1043 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP2Q9UGN5 583 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC125Q86Z20 511 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 TRIM58Q8NG06 486 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 BCAP29Q9UHQ4 241 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 USH1CQ9Y6N9 552 aa12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
EFTUD2-202ENST00000426333 PIK3C2AO00443 1686 aa12.15□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SLC1A4P43007 532 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PARP10Q53GL7 1025 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CCDC170Q8IYT3 715 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA1468Q9P260 1216 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC11AQ9Y240 323 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 STRCQ7RTU9 1775 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF123Q5XPI4 1314 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 HIP1RO75146 1068 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 STAT1P42224 750 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP2R5EQ16537 467 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CTAGE3PQ8IX95 158 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM71BQ8TC56 605 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RILPQ96NA2 401 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 IFNB1P01574 187 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ADCY7P51828 1080 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ADALQ6DHV7 355 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CABP7Q86V35 215 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MYCT1Q8N699 235 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 BABAM1Q9NWV8 329 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TTC36A6NLP5 189 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAEAQ7L5Y9 396 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 VPS37BQ9H9H4 285 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 AMFRQ9UKV5 643 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KCNJ14Q9UNX9 436 aa12.14□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAN1A1P33908 653 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 MAP2K2P36507 400 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ADKP55263 362 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CERS3Q8IU89 383 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD42Q8N9B4 389 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 P3H4Q92791 437 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TBC1D7Q9P0N9 293 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 GCNT3O95395 438 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 CALCRLQ16602 461 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF790Q6PG37 636 aa12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
EFTUD2-202ENST00000426333 KLHL14Q9P2G3 628 aa12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms