RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 USP14P54578 494 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 UBE2HP62256 183 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 ATP2B2Q01814 1243 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 KLRC3Q07444 240 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 RILPL1Q5EBL4 403 aa11.07□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.07□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 RTEL1Q9NZ71 1219 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa11.07□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 SHTN1A0MZ66 631 aa11.06□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 C19orf81C9J6K1 198 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 YEATS4O95619 227 aa11.06□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 KRT2P35908 639 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 TRAPPC10P48553 1259 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 FAM160B2Q86V87 743 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 JMYQ8N9B5 988 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 LPAR1Q92633 364 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 MTMR8Q96EF0 704 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 SPATA32Q96LK8 384 aa11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 WDR18Q9BV38 432 aa11.06□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.06□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 GDF11O95390 407 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 EGFRP00533 1210 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 EPHX2P34913 555 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 NBR1Q14596 966 aa11.05□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 MYSM1Q5VVJ2 828 aa11.05□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 VCPKMTQ9H867 229 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 PICK1Q9NRD5 415 aa11.05□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 FEM1BQ9UK73 627 aa11.05□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 MYH15Q9Y2K3 1946 aa11.05□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 USP17L10C9JJH3 530 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB5O15062 677 aa11.04□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 CYTH3O43739 400 aa11.04□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 BLIDQ8IZY5 108 aa11.04□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 SLC39A14Q15043 492 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
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HDLBP-211ENST00000425989 ANO1Q5XXA6 986 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 ADALQ6DHV7 355 aa11.03□□□□□ -0.64
HDLBP-211ENST00000425989 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa11.03□□□□□ -0.64
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