RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424766.5

PMS1-211, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 3

Gene PMS1, Length 831 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-211ENST00000424766 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa24.16■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 MYPNQ86TC9 1320 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 BMP3P12645 472 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 LIFRP42702 1097 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 SLC1A4P43007 532 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 LY9Q9HBG7 655 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa24.15■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 ADGRA2Q96PE1 1338 aa24.14■■□□□ 1.46
PMS1-211ENST00000424766 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FOXN1O15353 648 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 PLA2G6O60733 806 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SNHG28P0DPA3 235 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 HERVK_113P62684 666 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 C17orf99Q6UX52 265 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 LBX2Q6XYB7 198 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 BACH2Q9BYV9 841 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FEM1BQ9UK73 627 aa24.14■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FLOT1O75955 427 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 PDHBP11177 359 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RPS6KB1P23443 525 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 DSG3P32926 999 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RUFY3Q7L099 469 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SENP2Q9HC62 589 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 MTMR7Q9Y216 660 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.13■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 GPR25O00155 361 aa24.12■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.12■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FBXL16Q8N461 479 aa24.12■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.12■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 TMEM232C9JQI7 657 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 BCRP11274 1271 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CPA1P15085 419 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FAM160B2Q86V87 743 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CPA4Q9UI42 421 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 TSKSQ9UJT2 592 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.11■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CCDC69A6NI79 296 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 ZNF543Q08ER8 600 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CCDC96Q2M329 555 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 NFXL1Q6ZNB6 911 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 KCTD1Q719H9 257 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.1■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 STAT2P52630 851 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FGD1P98174 961 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 Q6ZUG5 572 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 MB21D1Q8N884 522 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 CHMP4CQ96CF2 233 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 MAP3K14Q99558 947 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 MORF4L1Q9UBU8 362 aa24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FDX1P10109 184 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 SP3Q02447 781 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 TROAPQ12815 778 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 FAM110CQ1W6H9 321 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 POTEEQ6S8J3 1075 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.08■■□□□ 1.45
PMS1-211ENST00000424766 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 FKTNO75072 461 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 DDAH1O94760 285 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ATG4CQ96DT6 458 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 SLC12A7Q9Y666 1083 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.07■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 VWA5AO00534 786 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CALM1P0DP23 149 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CALM2P0DP24 149 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 CALM3P0DP25 149 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 LBX1P52954 281 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 GRM4Q14833 912 aa24.06■■□□□ 1.44
PMS1-211ENST00000424766 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.06■■□□□ 1.44
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