RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.19■□□□□ 0.98
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SH3BP1-202ENST00000417536 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP1-202ENST00000417536 PANX2Q96RD6 677 aa21.19■□□□□ 0.98
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SH3BP1-202ENST00000417536 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
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SH3BP1-202ENST00000417536 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
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SH3BP1-202ENST00000417536 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.13■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 USP17L21D6R901 530 aa21.13■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF569Q5MCW4 686 aa21.12■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 CALM1P0DP23 149 aa21.11■□□□□ 0.97
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SH3BP1-202ENST00000417536 CALM3P0DP25 149 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 GPSM2P81274 684 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM47AQ5JRC9 791 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 VPS16Q9H269 839 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC66A2RUB6 948 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 N4BP3O15049 544 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 ADAMTS3O15072 1205 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC25AP30304 524 aa21.11■□□□□ 0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP5P59047 1200 aa21.11■□□□□ 0.97
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